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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

[求助] 请教成键方式以及怎样用GaussView构建已有1人参与

如图所示的分子体系,与锌离子络合以后得到新的分子体系。实验上操作的时候一定是加入的带有锌离子的溶液,
1.请问与锌离子络合以后得到的新分子体系中Zn是怎么成键的?
2.用GaussView构建新的分子体系的时候应该怎么设置与周围的四个N的成键?
3.对新的分子体系进行第一性原理计算的时候不能带着两个单位的正电荷吧,怎么设置成中性体系呢?

谢谢大家.

请教成键方式以及怎样用GaussView构建
20141117173025.jpg
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。

zhangyujin: 回帖置顶 2014-11-19 11:00:25
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhangyujin at 2014-11-18 08:10:19
比如加入两个cl 阴离子去中和的话,用GaussView去画的时候是让Zn例子同时连接4个N和两个cl ?...

我以前曾经放在某个阳离子旁边,让它自己去优化,但最后都跑到别的地方去了。你可以做几个初始结构试试看结果怎么样。另外,不加阴离子的也算算,有可能阴离子的影响不大。
10楼2014-11-19 10:38:59
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangyujin: 金币+5, 有帮助 2014-11-19 11:03:05
可以改变键角等参数来调整分子的构象。
高斯的计算可以带电荷。
2楼2014-11-17 19:05:34
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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 绍敏郡主 at 2014-11-17 19:05:34
可以改变键角等参数来调整分子的构象。
高斯的计算可以带电荷。

高斯是可以带着电荷。但是真实的情况下起作用的不会是带着电荷的体系,一定是中性的。所以理论计算的时候应该考虑真实情况吧
Hardworking!!
3楼2014-11-17 20:16:07
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangyujin at 2014-11-17 20:16:07
高斯是可以带着电荷。但是真实的情况下起作用的不会是带着电荷的体系,一定是中性的。所以理论计算的时候应该考虑真实情况吧...

看你想得到什么信息。

有时候只算带电荷的离子就行了。

有时候需要算正负离子组成的晶体。

也有的时候算一对正负离子组成的分子。
4楼2014-11-17 20:28:24
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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 绍敏郡主 at 2014-11-17 20:28:24
看你想得到什么信息。

有时候只算带电荷的离子就行了。

有时候需要算正负离子组成的晶体。

也有的时候算一对正负离子组成的分子。...

我是用高斯计算络合前后两个体系的光学性质,光吸收 光发射谱情况。这种情况下,能直接带着电荷计算吗?络合前是中性体系,络合以后带着两个单位正电荷,结果能有可比性吗?
Hardworking!!
5楼2014-11-17 21:12:06
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绍敏郡主

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangyujin at 2014-11-17 21:12:06
我是用高斯计算络合前后两个体系的光学性质,光吸收 光发射谱情况。这种情况下,能直接带着电荷计算吗?络合前是中性体系,络合以后带着两个单位正电荷,结果能有可比性吗?...

我觉得可以带着电荷算,加不加补偿离子对电子跃迁的能量影响应该不大
6楼2014-11-17 21:22:31
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangyujin at 2014-11-17 13:16:07
高斯是可以带着电荷。但是真实的情况下起作用的不会是带着电荷的体系,一定是中性的。所以理论计算的时候应该考虑真实情况吧...

可以加上对光谱影响不大的阴离子做中和。
7楼2014-11-18 11:07:30
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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yongma2008 at 2014-11-18 11:07:30
可以加上对光谱影响不大的阴离子做中和。...

比如加入两个cl 阴离子去中和的话,用GaussView去画的时候是让Zn例子同时连接4个N和两个cl ?
Hardworking!!
8楼2014-11-18 15:10:19
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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yongma2008 at 2014-11-18 11:07:30
可以加上对光谱影响不大的阴离子做中和。...

还是说,直接放两个cl 原子在Zn 旁边就好呢? 谢谢
Hardworking!!
9楼2014-11-18 15:11:00
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