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[资源] 高斯03安装目录中exercise文件夹e3_01.gjf输入和计算结果分析

(一)输入文件分析

#T RHF/6-31G(d) Opt Test            

Ethylene Geometry Optimization

0 1
C
C 1 CC
H 1 CH 2 HCC
H 1 CH 2 HCC 3 180.
H 2 CH 1 HCC 3 180.
H 2 CH 1 HCC 4 180.
      Variables:
CC=1.31
CH=1.07
HCC=121.5

第1行:计算执行路径  以“#”开头,“T”表示打印重要的输出部分,“RHF”表示采用限制性的Hartree-Fock方法,“6-31G(d)” 是采用的基组,“Opt”表示进行几何优化,“Test”表示不计入高斯工作档案。

第2行:空行  这是高斯输入的格式要求

第3行:标题 是对计算的一个说明,对计算过程和输入输出文件名无影响

第4行:空行

第5行:电荷和自旋多重度 此处电荷为0,自旋多重度为1

第6-15行:分子说明,其中6-11行是分子坐标,12-15行是变量说明

采用G03打开该文件,显示如下:




采用Gview打开该文件,显示如下:




(二)输出文件分析

以下是版权和引用说明部分。

Entering Link 1 = d:\G03W\l1.exe PID=      1016.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003, Gaussian, Inc.
                  All Rights Reserved.
  
This is the Gaussian(R) 03 program.  It is based on the
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.
  
This software contains proprietary and confidential information,
including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.
  
This software is provided under written license and may be
used, copied, transmitted, or stored only in accord with that
written license.
  
The following legend is applicable only to US Government
contracts under DFARS:
  
                    RESTRICTED RIGHTS LEGEND
  
Use, duplication or disclosure by the US Government is subject
to restrictions as set forth in subparagraph (c)(1)(ii) of the
Rights in Technical Data and Computer Software clause at DFARS
252.227-7013.
  
Gaussian, Inc.
Carnegie Office Park, Building 6, Pittsburgh, PA 15106 USA
  
The following legend is applicable only to US Government
contracts under FAR:
  
                    RESTRICTED RIGHTS LEGEND
  
Use, reproduction and disclosure by the US Government is subject
to restrictions as set forth in subparagraph (c) of the
Commercial Computer Software - Restricted Rights clause at FAR
52.227-19.
  
Gaussian, Inc.
Carnegie Office Park, Building 6, Pittsburgh, PA 15106 USA
  
  
---------------------------------------------------------------
Warning -- This program may not be used in any manner that
competes with the business of Gaussian, Inc. or will provide
assistance to any competitor of Gaussian, Inc.  The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
Gaussian, Inc. access to this program.  By using this program,
the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------
  

Cite this work as:
Gaussian 03, Revision B.01,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven,
K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi,
V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota,
R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao,
H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross,
C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev,
A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala,
K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg,
V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain,
O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari,
J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford,
J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz,
I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham,
C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill,
B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople,
Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 2003.

以下是高斯版本说明。
*********************************************
Gaussian 03:  x86-Win32-G03RevB.01 3-Mar-2003
                  31-Jan-2007
*********************************************

以下是最大硬盘使用量、计算执行路径、标题和分子说明部分。
Default route:  MaxDisk=2000MB
------------------------
#T RHF/6-31G(d) Opt Test
------------------------
------------------------------
Ethylene Geometry Optimization
------------------------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
C
C                    1    CC
H                    1    CH       2    HCC
H                    1    CH       2    HCC      3     180.     0
H                    2    CH       1    HCC      3     180.     0
H                    2    CH       1    HCC      4     180.     0
       Variables:
  CC                    1.31                     
  CH                    1.07                     
  HCC                 121.5                     


下面一行是高斯使用的分隔行,用于分隔每步优化的结果。

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

下面一行说明初始化完成。
Initialization pass.

下面是初始结构参数,单位是埃(长度)和度(角度)。第1列的R表示键长,A表示键角,D表示二面角,第2列括号中的数字表示原子编号(与输入文件的编号对应),第3列是值,第4列是倒数。
                           ----------------------------
                           !    Initial Parameters    !
                           ! (Angstroms and Degrees)  !
--------------------------                            --------------------------
! Name  Definition              Value          Derivative Info.                !
--------------------------------------------------------------------------------
! R1    R(1,2)                  1.31           estimate D2E/DX2                !
! R2    R(1,3)                  1.07           estimate D2E/DX2                !
! R3    R(1,4)                  1.07           estimate D2E/DX2                !
! R4    R(2,5)                  1.07           estimate D2E/DX2                !
! R5    R(2,6)                  1.07           estimate D2E/DX2                !
! A1    A(2,1,3)              121.5            estimate D2E/DX2                !
! A2    A(2,1,4)              121.5            estimate D2E/DX2                !
! A3    A(3,1,4)              117.0            estimate D2E/DX2                !
! A4    A(1,2,5)              121.5            estimate D2E/DX2                !
! A5    A(1,2,6)              121.5            estimate D2E/DX2                !
! A6    A(5,2,6)              117.0            estimate D2E/DX2                !
! D1    D(3,1,2,5)            180.0            estimate D2E/DX2                !
! D2    D(3,1,2,6)              0.0            estimate D2E/DX2                !
! D3    D(4,1,2,5)              0.0            estimate D2E/DX2                !
! D4    D(4,1,2,6)            180.0            estimate D2E/DX2                !
--------------------------------------------------------------------------------
Number of steps in this run=  25 maximum allowed number of steps= 100.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

下面采用原子之间的距离描述分子的结构。

                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  C    0.000000
     2  C    1.310000   0.000000
     3  H    1.070000   2.079849   0.000000
     4  H    1.070000   2.079849   1.824650   0.000000
     5  H    2.079849   1.070000   3.037309   2.428147   0.000000
     6  H    2.079849   1.070000   2.428147   3.037309   1.824650
                    6
     6  H    0.000000
Framework group  D2H[C2"(C.C),SG(H4)]
Deg. of freedom     3

下面采用标准坐标(将坐标原点放在分子的电荷中心上)描述分子的结构。
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1          6             0        0.000000    0.000000    0.655000
    2          6             0        0.000000    0.000000   -0.655000
    3          1             0        0.000000    0.912325    1.214073
    4          1             0        0.000000   -0.912325    1.214073
    5          1             0        0.000000   -0.912325   -1.214073
    6          1             0        0.000000    0.912325   -1.214073
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):    150.6166325     31.1220164     25.7924956
    38 basis functions,    72 primitive gaussians,    38 cartesian basis functions
     8 alpha electrons        8 beta electrons
       nuclear repulsion energy        33.8823555137 Hartrees.
NAtoms=    6 NActive=    6 NUniq=    2 SFac= 5.66D+00 NAtFMM=   60 Big=F
Harris functional with IExCor=  205 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 1.61D-01 ExpMax= 3.05D+03 ExpMxC= 4.57D+02 IAcc=1 IRadAn=         1 AccDes= 1.00D-06
HarFok:  IExCor= 205 AccDes= 1.00D-06 IRadAn=         1 IDoV=1
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000

下面是初始猜轨道的对称性。
Initial guess orbital symmetries:
       Occupied  (AG) (B1U) (AG) (B1U) (B2U) (AG) (B3G) (B3U)
       Virtual   (B2G) (B2U) (AG) (B1U) (B3G) (B1U) (AG) (B3U)
                 (B2U) (B2G) (B1U) (AG) (B2U) (B3G) (B1U) (AG)
                 (B1U) (B3G) (B3U) (B1G) (AU) (AG) (B2U) (AG) (B1U)
                 (B2G) (B1U) (B3G) (AG) (B1U)
The electronic state of the initial guess is 1-AG.

出现下面的信息表明自洽场收敛,E(RHF)为能量值,使用Convg为自洽场收敛判据值,-V/T为维里系数,S**2为自旋平方。
              SCF Done:  E(RHF) =  -78.0315145604     A.U. after    9 cycles
             Convg  =    0.2319D-08             -V/T =  1.9998
             S**2   =   0.0000

下面是密立根布局数分析。

**********************************************************************

            Population analysis using the SCF density.

**********************************************************************

Orbital symmetries:
       Occupied  (AG) (B1U) (AG) (B1U) (B2U) (AG) (B3G) (B3U)
       Virtual   (B2G) (AG) (B2U) (B1U) (B3G) (B1U) (AG) (B2U)
                 (B3U) (AG) (B2G) (B1U) (B2U) (B3G) (AG) (B1U)
                 (B1U) (B3G) (B3U) (B1G) (AU) (AG) (B2U) (AG) (B1U)
                 (B2G) (B3G) (B1U) (AG) (B1U)
The electronic state is 1-AG.
Alpha  occ. eigenvalues --  -11.22134 -11.21947  -1.03633  -0.79020  -0.64464
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.58677  -0.50340  -0.37575
Alpha virt. eigenvalues --    0.18586   0.26741   0.29486   0.31411   0.39387
Alpha virt. eigenvalues --    0.49615   0.65878   0.77082   0.77163   0.85103
Alpha virt. eigenvalues --    0.89554   0.97283   1.11282   1.16829   1.21714
Alpha virt. eigenvalues --    1.22643   1.34882   1.50064   1.75129   1.81223
Alpha virt. eigenvalues --    2.13960   2.20518   2.34970   2.42887   2.65590
Alpha virt. eigenvalues --    2.73956   3.09167   3.09864   4.53736   4.67607
          Condensed to atoms (all electrons):

下面给出每个原子上的净电荷。
Mulliken atomic charges:
              1
     1  C   -0.352624
     2  C   -0.352624
     3  H    0.176312
     4  H    0.176312
     5  H    0.176312
     6  H    0.176312

下一行是整个分子的总电荷。
Sum of Mulliken charges=   0.00000
Atomic charges with hydrogens summed into heavy atoms:
              1
     1  C    0.000000
     2  C    0.000000
     3  H    0.000000
     4  H    0.000000
     5  H    0.000000
     6  H    0.000000
Sum of Mulliken charges=   0.00000
Electronic spatial extent (au):  =    80.7260
Charge=     0.0000 electrons
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=     0.0000    Y=     0.0000    Z=     0.0000  Tot=     0.0000

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

[ Last edited by longer163 on 2008-5-17 at 22:03 ]
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下面是第3步的优化结果。

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Internal  Forces:  Max     0.000083925 RMS     0.000044663
Step number   3 out of a maximum of  25
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
Trust test= 1.04D+00 RLast= 4.50D-03 DXMaxT set to 3.00D-01
     Eigenvalues ---    0.03279   0.03279   0.03279   0.15404   0.16000
     Eigenvalues ---    0.16000   0.16000   0.37230   0.37230   0.37230
     Eigenvalues ---    0.37306   0.737211000.000001000.000001000.00000
Quartic linear search produced a step of  0.03419.
Iteration  1 RMS(Cart)=  0.00026871 RMS(Int)=  0.00000004
Iteration  2 RMS(Cart)=  0.00000004 RMS(Int)=  0.00000000
Variable       Old X    -DE/DX   Delta X   Delta X   Delta X     New X
                                 (Linear)    (Quad)   (Total)
    R1        2.48881  -0.00008  -0.00013  -0.00001  -0.00014   2.48867
    R2        2.03337  -0.00003  -0.00004  -0.00003  -0.00007   2.03330
    R3        2.03337  -0.00003  -0.00004  -0.00003  -0.00007   2.03330
    R4        2.03337  -0.00003  -0.00004  -0.00003  -0.00007   2.03330
    R5        2.03337  -0.00003  -0.00004  -0.00003  -0.00007   2.03330
    A1        2.12573   0.00004   0.00000   0.00028   0.00028   2.12601
    A2        2.12573   0.00004   0.00000   0.00028   0.00028   2.12601
    A3        2.03173  -0.00008  -0.00001  -0.00055  -0.00056   2.03117
    A4        2.12573   0.00004   0.00000   0.00028   0.00028   2.12601
    A5        2.12573   0.00004   0.00000   0.00028   0.00028   2.12601
    A6        2.03173  -0.00008  -0.00001  -0.00055  -0.00056   2.03117
    D1        3.14159   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   3.14159
    D2        0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
    D3        0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
    D4        3.14159   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   3.14159
第3步优化收敛。
         Item              Value     Threshold  Converged?
Maximum Force              0.000084     0.000450     YES
RMS     Force                0.000045     0.000300     YES
Maximum Displacement     0.000374     0.001800     YES
RMS     Displacement         0.000269     0.001200     YES

收敛后会出现下面两行信息。
Optimization completed.
    -- Stationary point found.

给出优化后(最后一步)的坐标。
                           ----------------------------
                           !   Optimized Parameters   !
                           ! (Angstroms and Degrees)  !
--------------------------                            --------------------------
! Name  Definition              Value          Derivative Info.                !
--------------------------------------------------------------------------------
! R1    R(1,2)                  1.317          -DE/DX =   -0.0001              !
! R2    R(1,3)                  1.076          -DE/DX =    0.0                 !
! R3    R(1,4)                  1.076          -DE/DX =    0.0                 !
! R4    R(2,5)                  1.076          -DE/DX =    0.0                 !
! R5    R(2,6)                  1.076          -DE/DX =    0.0                 !
! A1    A(2,1,3)              121.7952         -DE/DX =    0.0                 !
! A2    A(2,1,4)              121.7952         -DE/DX =    0.0                 !
! A3    A(3,1,4)              116.4096         -DE/DX =   -0.0001              !
! A4    A(1,2,5)              121.7952         -DE/DX =    0.0                 !
! A5    A(1,2,6)              121.7952         -DE/DX =    0.0                 !
! A6    A(5,2,6)              116.4096         -DE/DX =   -0.0001              !
! D1    D(3,1,2,5)            180.0            -DE/DX =    0.0                 !
! D2    D(3,1,2,6)              0.0            -DE/DX =    0.0                 !
! D3    D(4,1,2,5)              0.0            -DE/DX =    0.0                 !
! D4    D(4,1,2,6)            180.0            -DE/DX =    0.0                 !
--------------------------------------------------------------------------------
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  C    0.000000
     2  C    1.317021   0.000000
     3  H    1.076015   2.094203   0.000000
     4  H    1.076015   2.094203   1.829089   0.000000
     5  H    2.094203   1.076015   3.058176   2.450893   0.000000
     6  H    2.094203   1.076015   2.450893   3.058176   1.829089
                    6
     6  H    0.000000
Framework group  D2H[C2"(C.C),SG(H4)]
Deg. of freedom     3
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1          6             0        0.000000    0.000000    0.658510
    2          6             0        0.000000    0.000000   -0.658510
    3          1             0        0.000000    0.914545    1.225446
    4          1             0        0.000000   -0.914545    1.225446
    5          1             0        0.000000   -0.914545   -1.225446
    6          1             0        0.000000    0.914545   -1.225446
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):    149.8864217     30.7013316     25.4818649

**********************************************************************

            Population analysis using the SCF density.

**********************************************************************

Orbital symmetries:
       Occupied  (AG) (B1U) (AG) (B1U) (B2U) (AG) (B3G) (B3U)
       Virtual   (B2G) (AG) (B2U) (B1U) (B3G) (B1U) (AG) (B2U)
                 (B3U) (AG) (B2G) (B1U) (B2U) (B3G) (AG) (B1U)
                 (B1U) (B3G) (B3U) (B1G) (AU) (AG) (B2U) (AG) (B1U)
                 (B2G) (B3G) (B1U) (AG) (B1U)
The electronic state is 1-AG.
Alpha  occ. eigenvalues --  -11.22432 -11.22252  -1.03314  -0.78953  -0.64073
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.58641  -0.50201  -0.37436
Alpha virt. eigenvalues --    0.18390   0.26676   0.29316   0.31116   0.39303
Alpha virt. eigenvalues --    0.49561   0.66184   0.76810   0.77267   0.85232
Alpha virt. eigenvalues --    0.89375   0.96625   1.11004   1.16371   1.21209
Alpha virt. eigenvalues --    1.22135   1.34403   1.48597   1.74783   1.81519
Alpha virt. eigenvalues --    2.13735   2.20075   2.33991   2.41947   2.63931
Alpha virt. eigenvalues --    2.73142   3.08462   3.08881   4.53175   4.67324


下面是优化后的密立根电荷分析。
          Condensed to atoms (all electrons):
Mulliken atomic charges:
              1
     1  C   -0.352753
     2  C   -0.352753
     3  H    0.176377
     4  H    0.176377
     5  H    0.176377
     6  H    0.176377
Sum of Mulliken charges=   0.00000
Atomic charges with hydrogens summed into heavy atoms:
              1
     1  C    0.000000
     2  C    0.000000
     3  H    0.000000
     4  H    0.000000
     5  H    0.000000
     6  H    0.000000
Sum of Mulliken charges=   0.00000
Electronic spatial extent (au):  =    81.4194
Charge=     0.0000 electrons

下面是二极距。
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=     0.0000    Y=     0.0000    Z=     0.0000  Tot=     0.0000

Test job not archived.

下面是归档文件。
1|1|UNPC-UNK|FOpt|RHF|6-31G(d)|C2H4|PCUSER|31-Jan-2007|0||#T RHF/6-31G
(D) OPT TEST||Ethylene Geometry Optimization||0,1|C,0.,0.,-0.658510405
1|C,0.,0.,0.6585104051|H,0.9145445905,0.,-1.225446446|H,-0.9145445905,
0.,-1.225446446|H,-0.9145445905,0.,1.225446446|H,0.9145445905,0.,1.225
446446||Version=x86-Win32-G03RevB.01|State=1-AG|HF=-78.0317181|RMSD=7.
215e-009|RMSF=6.056e-005|Dipole=0.,0.,0.|PG=D02H [C2"(C1.C1),SG(H4)]||
@

下面是高斯计算完成后给出的谚语,由系统随机选定。
AND HERE I AM, FOR ALL MY LORE,
THE WRETCHED FOOL I WAS BEFORE.
CALLED MASTER OF ARTS, AND DOCTOR TO BOOT,
FOR TEN YEARS ALMOST I CONFUTE
AND UP AND DOWN, WHEREVER IT GOES
I DRAG MY STUDENTS BY THE NOSE --
AND SEE THAT FOR ALL OUR SCIENCE AND ART
WE CAN KNOW NOTHING.  IT BURNS MY HEART.

                                       -- FAUST

下面是计算消耗的CPU时间,实际时间要大于CPU时间。
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 10.0 seconds.

相关的文件信息。
File lengths (MBytes):  RWF=     12 Int=      0 D2E=      0 Chk=      7 Scr=      1

下面一行是高斯正常结束的标志。
Normal termination of Gaussian 03 at Wed Jan 31 19:30:21 2007.
3楼2008-05-12 19:51:55
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金虫 (小有名气)


下面是第1步(Step number 1)的优化结果。

Internal  Forces:  Max     0.011072236 RMS     0.003805039
Step number   1 out of a maximum of  25
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
Second derivative matrix not updated -- first step.
     Eigenvalues ---    0.03279   0.03279   0.03279   0.16000   0.16000
     Eigenvalues ---    0.16000   0.16000   0.37230   0.37230   0.37230
     Eigenvalues ---    0.37230   0.644911000.000001000.000001000.00000
Linear search not attempted -- first point.
Iteration  1 RMS(Cart)=  0.01299341 RMS(Int)=  0.00003088
Iteration  2 RMS(Cart)=  0.00003533 RMS(Int)=  0.00000000
Iteration  3 RMS(Cart)=  0.00000000 RMS(Int)=  0.00000000

下面是分子结构参数的旧值和新值。
Variable       Old X    -DE/DX   Delta X   Delta X   Delta X     New X
                                 (Linear)    (Quad)   (Total)
    R1        2.47554   0.01107   0.00000   0.01716   0.01716   2.49270
    R2        2.02201   0.00465   0.00000   0.01249   0.01249   2.03449
    R3        2.02201   0.00465   0.00000   0.01249   0.01249   2.03449
    R4        2.02201   0.00465   0.00000   0.01249   0.01249   2.03449
    R5        2.02201   0.00465   0.00000   0.01249   0.01249   2.03449
    A1        2.12058   0.00081   0.00000   0.00507   0.00507   2.12564
    A2        2.12058   0.00081   0.00000   0.00507   0.00507   2.12564
    A3        2.04204  -0.00163   0.00000  -0.01014  -0.01014   2.03190
    A4        2.12058   0.00081   0.00000   0.00507   0.00507   2.12564
    A5        2.12058   0.00081   0.00000   0.00507   0.00507   2.12564
    A6        2.04204  -0.00163   0.00000  -0.01014  -0.01014   2.03190
    D1        3.14159   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   3.14159
    D2        0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
    D3        0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
    D4        3.14159   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   3.14159

下面是收敛结果分析,第1行为力的最大值,第2行为根均方力;第3行最大位移,第4行为根均方位移。第1列为项目名称,第2列为对应的值,第3列为高斯采用的收敛判据,第4列为收敛结果判断,当每一项的第4列都为YES的时候认为收敛。
         Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.011072     0.000450     NO
RMS     Force            0.003805     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.023880     0.001800     NO
RMS     Displacement     0.013007     0.001200     NO
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

下面是对第1步优化后分子结构的描述。

                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  C    0.000000
     2  C    1.319079   0.000000
     3  H    1.076607   2.096506   0.000000
     4  H    1.076607   2.096506   1.830191   0.000000
     5  H    2.096506   1.076607   3.060861   2.453420   0.000000
     6  H    2.096506   1.076607   2.453420   3.060861   1.830191
                    6
     6  H    0.000000
Framework group  D2H[C2"(C.C),SG(H4)]
Deg. of freedom     3
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1          6             0        0.000000    0.000000    0.659539
    2          6             0        0.000000    0.000000   -0.659539
    3          1             0        0.000000    0.915095    1.226710
    4          1             0        0.000000   -0.915095    1.226710
    5          1             0        0.000000   -0.915095   -1.226710
    6          1             0        0.000000    0.915095   -1.226710
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):    149.7060548     30.6175574     25.4189325
    38 basis functions,    72 primitive gaussians,    38 cartesian basis functions
     8 alpha electrons        8 beta electrons
       nuclear repulsion energy        33.6519866398 Hartrees.
NAtoms=    6 NActive=    6 NUniq=    2 SFac= 5.66D+00 NAtFMM=   60 Big=F
Initial guess read from the read-write file:
Initial guess orbital symmetries:
       Occupied  (AG) (B1U) (AG) (B1U) (B2U) (AG) (B3G) (B3U)
       Virtual   (B2G) (AG) (B2U) (B1U) (B3G) (B1U) (AG) (B2U)
                 (B3U) (AG) (B2G) (B1U) (B2U) (B3G) (AG) (B1U)
                 (B1U) (B3G) (B3U) (B1G) (AU) (AG) (B2U) (AG) (B1U)
                 (B2G) (B3G) (B1U) (AG) (B1U)
Harris functional with IExCor=  205 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 1.61D-01 ExpMax= 3.05D+03 ExpMxC= 4.57D+02 IAcc=1 IRadAn=         1 AccDes= 1.00D-06
HarFok:  IExCor= 205 AccDes= 1.00D-06 IRadAn=         1 IDoV=1
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
SCF Done:  E(RHF) =  -78.0317108710     A.U. after    7 cycles
             Convg  =    0.6503D-08             -V/T =  2.0008
             S**2   =   0.0000

下面是第2步的优化结果。

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Internal  Forces:  Max     0.002986854 RMS     0.000814597
Step number   2 out of a maximum of  25
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
Trust test= 8.31D-01 RLast= 3.50D-02 DXMaxT set to 3.00D-01
     Eigenvalues ---    0.03279   0.03279   0.03279   0.15712   0.16000
     Eigenvalues ---    0.16000   0.16000   0.37230   0.37230   0.37230
     Eigenvalues ---    0.37767   0.752141000.000001000.000001000.00000
Quartic linear search produced a step of -0.14055.
Iteration  1 RMS(Cart)=  0.00152104 RMS(Int)=  0.00000004
Iteration  2 RMS(Cart)=  0.00000005 RMS(Int)=  0.00000000
Variable       Old X    -DE/DX   Delta X   Delta X   Delta X     New X
                                 (Linear)    (Quad)   (Total)
    R1        2.49270  -0.00299  -0.00241  -0.00148  -0.00389   2.48881
    R2        2.03449  -0.00051  -0.00175   0.00064  -0.00112   2.03337
    R3        2.03449  -0.00051  -0.00175   0.00064  -0.00112   2.03337
    R4        2.03449  -0.00051  -0.00175   0.00064  -0.00112   2.03337
    R5        2.03449  -0.00051  -0.00175   0.00064  -0.00112   2.03337
    A1        2.12564   0.00001  -0.00071   0.00080   0.00008   2.12573
    A2        2.12564   0.00001  -0.00071   0.00080   0.00008   2.12573
    A3        2.03190  -0.00003   0.00142  -0.00159  -0.00017   2.03173
    A4        2.12564   0.00001  -0.00071   0.00080   0.00008   2.12573
    A5        2.12564   0.00001  -0.00071   0.00080   0.00008   2.12573
    A6        2.03190  -0.00003   0.00142  -0.00159  -0.00017   2.03173
    D1        3.14159   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   3.14159
    D2        0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
    D3        0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000
    D4        3.14159   0.00000   0.00000   0.00000   0.00000   3.14159
         Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.002987     0.000450     NO
RMS     Force            0.000815     0.000300     NO
Maximum Displacement     0.002388     0.001800     NO
RMS     Displacement     0.001521     0.001200     NO
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  C    0.000000
     2  C    1.317021   0.000000
     3  H    1.076015   2.094203   0.000000
     4  H    1.076015   2.094203   1.829089   0.000000
     5  H    2.094203   1.076015   3.058176   2.450893   0.000000
     6  H    2.094203   1.076015   2.450893   3.058176   1.829089
                    6
     6  H    0.000000
Framework group  D2H[C2"(C.C),SG(H4)]
Deg. of freedom     3
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1          6             0        0.000000    0.000000    0.658510
    2          6             0        0.000000    0.000000   -0.658510
    3          1             0        0.000000    0.914545    1.225446
    4          1             0        0.000000   -0.914545    1.225446
    5          1             0        0.000000   -0.914545   -1.225446
    6          1             0        0.000000    0.914545   -1.225446
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):    149.8864217     30.7013316     25.4818649
    38 basis functions,    72 primitive gaussians,    38 cartesian basis functions
     8 alpha electrons        8 beta electrons
       nuclear repulsion energy        33.6887991345 Hartrees.
NAtoms=    6 NActive=    6 NUniq=    2 SFac= 5.66D+00 NAtFMM=   60 Big=F
Initial guess read from the read-write file:
Initial guess orbital symmetries:
       Occupied  (AG) (B1U) (AG) (B1U) (B2U) (AG) (B3G) (B3U)
       Virtual   (B2G) (AG) (B2U) (B1U) (B3G) (B1U) (AG) (B2U)
                 (B3U) (AG) (B2G) (B1U) (B2U) (B3G) (AG) (B1U)
                 (B1U) (B3G) (B3U) (B1G) (AU) (AG) (B2U) (AG) (B1U)
                 (B2G) (B3G) (B1U) (AG) (B1U)
SCF Done:  E(RHF) =  -78.0317180626     A.U. after    6 cycles
             Convg  =    0.7215D-08             -V/T =  2.0006
             S**2   =   0.0000
2楼2008-05-12 19:51:44
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dongping001

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

小伙子很努力很能干
考你一个:#T中的T是什么意思?
4楼2008-05-12 23:24:19
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引用回帖:
Originally posted by dongping001 at 2008-5-12 23:24:
小伙子很努力很能干
考你一个:#T中的T是什么意思?

第1行:计算执行路径  以“#”开头,“T”表示打印重要的输出部分
5楼2008-05-12 23:34:50
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dongping001

木虫 (正式写手)


不许替考
6楼2008-05-13 00:17:55
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longer163

金虫 (小有名气)


晕,里面不是有吗
第1行:计算执行路径  以“#”开头,“T”表示打印重要的输出部分,“RHF”表示采用限制性的Hartree-Fock方法,“6-31G(d)” 是采用的基组,“Opt”表示进行几何优化,“Test”表示不计入高斯工作档案。
7楼2008-05-13 00:32:08
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huahua1981

铜虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

我也考你一个这个东西表示什么意思 怎么得出来的
Occupied  (AG) (B1U) (AG) (B1U) (B2U) (AG) (B3G) (B3U)
       Virtual   (B2G) (B2U) (AG) (B1U) (B3G) (B1U) (AG) (B3U)
                 (B2U) (B2G) (B1U) (AG) (B2U) (B3G) (B1U) (AG)
                 (B1U) (B3G) (B3U) (B1G) (AU) (AG) (B2U) (AG) (B1U)
                 (B2G) (B1U) (B3G) (AG) (B1U)
8楼2008-05-14 09:48:52
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dongping001

木虫 (正式写手)


续考:T是哪个英文单词的缩写?
(T表示在out文件中仅仅输出重要的内容,我第一次确实没看全第一行)
9楼2008-05-14 10:27:23
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)


引用回帖:
Originally posted by dongping001 at 2008-5-14 10:27:
续考:T是哪个英文单词的缩写?
(T表示在out文件中仅仅输出重要的内容,我第一次确实没看全第一行)

terse 精简输出,只输出最重要的信息。
10楼2008-05-14 13:10:00
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

如果楼住能把#P格式的输出文件给大家讲解讲解,我想会有更多的新手感谢你的。
11楼2008-05-14 13:14:41
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longer163

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2008-5-14 13:14:
如果楼住能把#P格式的输出文件给大家讲解讲解,我想会有更多的新手感谢你的。

详细输出的没注意过………………
等有空看看。
12楼2008-05-14 18:45:12
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bingfei101


很好,很详细
13楼2008-05-17 13:50:16
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grapefruit

金虫 (小有名气)


呵呵,楼主是高手,我们实验室的一致认同的哈~~~
14楼2008-05-25 20:50:03
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longer163

金虫 (小有名气)


^^^^

[ Last edited by longer163 on 2008-5-28 at 11:30 ]
15楼2008-05-25 21:01:05
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dengwei_19

木虫 (著名写手)


高手高手~~学习学习~~
16楼2008-05-25 23:34:08
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