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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】hyperchem 电荷计算,水可及表面积
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veradpp

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】hyperchem 电荷计算,水可及表面积

文献中的话：
total dipole moment,  electron excess charge of the most negatively charged atom,  and water-accessible molecular surface area, A , were calculated by standard molecular modeling. The HYPER CHEM program for personal computers with the extension CHEMPLUS was used for the calculations of these parameters.

请问后面两个参数，电子额外电荷和水可及表面积具体是怎么计算的？
我用QSARPROPERTIES 计算的电荷全都是零，并且只能计算溶剂可及表面积，请高手赐教，谢谢

[ Last edited by veradpp on 2008-5-13 at 10:55 ]
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1楼 2008-05-12 17:00:33
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dongping001

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
计算有关电子方面的性质一定要用量子力学方法（半经验或从头算，DFT）计算完以后，原子的各个净电荷就可以显示出来（在DISPLAY菜单），算完以后再执行其他模块计算，试试看看。
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2楼2008-05-12 19:08:13
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veradpp

木虫 (正式写手)
display ---label---charge, 可以显示每个原子的电荷情况，谢谢P
在请教一下，electron excess charge of the most negatively charged atom，需要自己统计计算吗？有没有直接计算的选项按钮？water-accessible molecular surface area是否等于溶剂可及表面积啊？谢谢啊。
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3楼2008-05-12 19:29:16
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dongping001

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
veradpp(金币+3,VIP+0):谢谢帮助：）
楼主做的东西俺没做过，根据我做过计算分子光谱和分子轨道方面的经验就是先做量子力学然后再点别的，你如果涉及到电子密度方面的最好先算一下（结构优化）然后就挨个点。我觉着你翻译是对的，在hyperchem里面默认的溶剂就是水
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4楼2008-05-12 23:36:19
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