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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 绘图软件
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xuanyuanhu

木虫 (著名写手)

[求助] 绘图软件 已有4人参与

这种图片使用什么软件做的？如何使用？最好能提供一份相应的软件？

绘图软件
t7.logo.gif
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新的一年，新的辉煌！
1楼 2014-11-12 16:33:09
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KIF17

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
This is called 'sequence logo'.

If you read wi--ki, http://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_logo
Tools for creating sequence logos

    RWebLogo R Code, wrapper for python code (BSD licence)
    WebLogo Python Code Python Code (BSD license, somewhat difficult to use)
    WebLogo 3.0 (Online)
    Seq2Logo (Online app. for peptide alignments feat. pseudo count, sequence weighting and two-sided representation)
    MoRAine (Online application with integrated binding site re-annotation)
    GENIO (Online)
    PWM-based logo (Online application for motif PWM-based models)
    LogoBar (Java application)
    CorreLogo An online server for 3D sequence logos of RNA and DNA alignments
    seqlogo C function to generate DNA sequence logos
    [1] MS-Word AddOn Ribbon that allows generation of consensus logos
    RILogo program and web server for creating logos for two interacting RNAs

Otherwise http://schneider.ncifcrf.gov/logoprograms.html
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2楼2014-11-13 01:03:08
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi
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3楼2014-11-13 09:02:30
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xuanyuanhu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by KIF17 at 2014-11-13 01:03:08
This is called 'sequence logo'.

If you read wi--ki, http://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_logo
Tools for creating sequence logos

    RWebLogo R Code, wrapper for python code (BSD licence)
    ...

有没有在个人电脑上可以实现的方法或者软件？这些好像都是在线的方法啊
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新的一年，新的辉煌！
4楼2014-11-15 19:40:50
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xuanyuanhu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2014-11-13 09:02:30
http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi

有没有在个人电脑上可以实现的方法或者软件？这些好像都是在线的方法啊
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新的一年，新的辉煌！
5楼2014-11-15 19:41:07
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

有在线的不好吗？
想批量的话，写程序把数据送到服务器就行了
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6楼2014-11-16 07:03:07
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xuanyuanhu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wizardfan at 2014-11-16 07:03:07
有在线的不好吗？
想批量的话，写程序把数据送到服务器就行了

担心这些服务器有后窗。。。
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新的一年，新的辉煌！
7楼2014-11-16 08:43:56
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cory0931

至尊木虫 (文坛精英)

巫山云

【答案】应助回帖

貌似CLC genomics workbench有这个功能，不过正版软件挺贵的，PJ版的网上也是极其难找；
也可能有别的可替代的类似软件，就不知道了；
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锤之千古
8楼2014-11-16 11:16:35
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chengyi__

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

http://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_logo
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9楼2014-11-16 22:18:44
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