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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 两条分子量为28000的不同分子链能否用计算机模拟两条链之间的相互作用
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hyee

金虫 (小有名气)

小虾米

[求助] 两条分子量为28000的不同分子链能否用计算机模拟两条链之间的相互作用 已有2人参与

想借助计算机模拟两种聚合物的相互作用。一种聚合物是聚砜另外一种是改性的聚砜。
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寂寞的梧桐
1楼 2014-11-10 00:52:46
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夏陌86℃

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-11-10 10:55:59
如果不考虑溶液环境，用全原子动力学就可以算，如果要考虑溶液环境，就用粗粒化动力学可以算，不知道你的目的是什么

请教您一个问题：我做的是有机分子在金属表面的吸附，用discover--minimize后进行dynamic总是会失败，结果中会出现：
Error: Dynamic: Energy differennce between successive steps in dynamic is greater than the user defined variable DEVIATION   .....
可是我把 Energy的值增大了很多，还是会出现，想请教一下原因？是不是之前的minimize 没有处理好，minimize用的smart 优化的。期待您的回复
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6楼2014-11-10 16:31:15
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hyee: 金币+2 2014-11-10 15:30:51
如果不考虑溶液环境，用全原子动力学就可以算，如果要考虑溶液环境，就用粗粒化动力学可以算，不知道你的目的是什么
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2楼2014-11-10 10:55:59
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
hyee: 金币+1, ★有帮助 2014-11-10 15:30:39
可以计算，关键是你这样计算后要做什么。有什么实际意义，自己要想清楚。否则算了也是白算。
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3楼2014-11-10 13:01:34
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hyee

金虫 (小有名气)

小虾米
引用回帖:
3楼: Originally posted by chuntao118 at 2014-11-10 13:01:34
可以计算，关键是你这样计算后要做什么。有什么实际意义，自己要想清楚。否则算了也是白算。

请问是通过Materials Studio实现吗？我电脑是双核的计算一天都没结果，怀疑不行。一方面，想通过模拟直观看到我所改性的聚砜对聚砜所起的改善其流动性的作用。这一部分是用数据说明。另一方面，想通过模拟生成动画效果的相互作用。最后，老师教授们说很难模拟，我不太相信。
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寂寞的梧桐
4楼2014-11-10 15:25:37
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