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snnsx

铁虫 (初入文坛)

[交流] 有无法分离的两到三种原核生物，如何对其进行测序，明确菌属 已有1人参与

我这儿有几种混在一起的菌无法分开，想要进行测序确定体系中的菌种。请问大家有什么好方法没？454高通量测序有点杀鸡用牛刀的赶脚了。
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THEREISAWILL,THEREISAWAY.
1楼 2014-11-05 21:38:58
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-07 11:38:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by snnsx at 2014-11-05 22:43:41
这个方法我以前没接触过，不知道ITS序列扩增的成功几率高不，测序的话能不能把体系中的菌株都测全了啊？
不好意思哈，不专业，问题多了点...

ITS应该很好扩，有通用引物，文献中很多，做微生物的很多都是用这个序列鉴定种属。关于ITS，自己去百度吧。
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4楼2014-11-05 23:03:47
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-07 11:38:20
就扩ITS序列，然后连载体测序，多挑几个菌落测，然后看测序结果去比对。
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2楼2014-11-05 22:13:13
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snnsx

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-11-05 22:13:13
就扩ITS序列，然后连载体测序，多挑几个菌落测，然后看测序结果去比对。

这个方法我以前没接触过，不知道ITS序列扩增的成功几率高不，测序的话能不能把体系中的菌株都测全了啊？
不好意思哈，不专业，问题多了点
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THEREISAWILL,THEREISAWAY.
3楼2014-11-05 22:43:41
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