【答案】应助回帖

11楼2014-11-11 21:06:58

doris.gao

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【答案】应助回帖

97%以上最好，但是有些只能配比到低于97%的，有些还能配比到好几个相似性为99%的，所以也要看具体的，我都是选择最高的三个。

12楼2014-11-13 16:39:13

妙淼2013

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3楼: Originally posted by korchagin at 2014-11-03 08:45:43
一般要求97%以上吧，参比要选好，要不光参比聚到一起了

你好，我想评请教一下就是我今天做的系统发育树和你说的一样，参比全在一起，是什么原因造成的呢？我在ncbi上比对的菌都是一个属的

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13楼2014-11-16 23:52:42

korchagin

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【答案】应助回帖

引用回帖:

13楼: Originally posted by 妙淼2013 at 2014-11-16 23:52:42
你好，我想评请教一下就是我今天做的系统发育树和你说的一样，参比全在一起，是什么原因造成的呢？我在ncbi上比对的菌都是一个属的
...

因为参比相似度太高了

14楼2014-11-17 11:00:04

youqiweigan

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6楼: Originally posted by 戴晓凤 at 2014-11-07 14:31:03
相似度低于95视为不同属，低于97视为新种，一个树需要二三十个序列，选前几个属，每个属三五个菌

要怎样选几个属呢？

15楼2014-11-18 11:11:34