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mashuyan13

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by dllchina at 2014-11-07 23:26:32
参比是根据进化树来决定的,有些编辑要求的严,可能还会让你带上这个属的典型种...

恩谢谢咯
11楼2014-11-11 21:06:58
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doris.gao

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

97%以上最好,但是有些只能配比到低于97%的,有些还能配比到好几个相似性为99%的,所以也要看具体的,我都是选择最高的三个。
12楼2014-11-13 16:39:13
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妙淼2013

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by korchagin at 2014-11-03 08:45:43
一般要求97%以上吧,参比要选好,要不光参比聚到一起了

你好,我想评请教一下就是我今天做的系统发育树和你说的一样,参比全在一起,是什么原因造成的呢?我在ncbi上比对的菌都是一个属的

[ 发自小木虫客户端 ]
13楼2014-11-16 23:52:42
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korchagin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
13楼: Originally posted by 妙淼2013 at 2014-11-16 23:52:42
你好,我想评请教一下就是我今天做的系统发育树和你说的一样,参比全在一起,是什么原因造成的呢?我在ncbi上比对的菌都是一个属的
...

因为参比相似度太高了
14楼2014-11-17 11:00:04
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youqiweigan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 戴晓凤 at 2014-11-07 14:31:03
相似度低于95视为不同属,低于97视为新种,一个树需要二三十个序列,选前几个属,每个属三五个菌

要怎样选几个属呢?
15楼2014-11-18 11:11:34
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