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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 构造聚合物
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世外人yww

铁虫 (初入文坛)

[交流] 构造聚合物 已有4人参与

我知道构造聚合物，是在build  那，然后弹出一个框框，会有组合选项（构成聚合物），  想问的是，那里选项搭配是有限的，想建个，聚丙烯酰胺，好像没有对应的选项可以组成这个物质？    是不是要自己画？应该怎么画重复单元，然后画成聚丙烯酰胺？  求助        ······金币少，希望不要介意~~~~(>_<~~~~

构造聚合物
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1楼 2014-10-23 23:17:09
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 感谢应助2 2014-12-12 08:03:39
引用回帖:
19楼: Originally posted by 豆豆sk8 at 2014-12-11 16:38:33
大神好，看到好多帖子都有大神的回复，而且就近，所以赶紧咨询下我的问题：
1、我模拟的体系包含一个聚合物1700个单体，6000个甲醇分子，1000个醋酸乙烯分子，共约9000分子（聚合物按照单体算），80000个原子，这 ...

这么大的体系我没做过 MS好像是有原子数限制的 你可以试试看 有可能超过MS的限制。如果可以建模，做好MD平衡时间长的准备。   退火一般是先建盒子再退火。  MD过程我比较倾向于先nvt最后npt。因为大多数是模拟的恒压体系

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
20楼2014-12-11 21:59:47
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://baike.baidu.com/view/193497.htm
单体是不是这样的？
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-10-24 08:44:12
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 应助指数+1, 感谢应助 2014-12-12 08:02:22
先画出单体结构，首尾分别添加一个H原子，build polymer——repeat unit设定刚才两个原子为head atom和tail atom
build polymer —— current project选择刚才画的单体结构
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CQU_wjq
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2014-10-24 09:41:07
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CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2014-10-24 09:41:07
先画出单体结构，首尾分别添加一个H原子，build polymer——repeat unit设定刚才两个原子为head atom和tail atom
build polymer —— current project选择刚才画的单体结构

大神，请问如果单体不确定，该怎么画，譬如Tween 80（聚氧乙烯山梨醇酐单油酸酯）？
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逆风奔跑。
4楼2014-10-24 10:30:37
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