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coolter2001

银虫 (小有名气)

[交流] [求助]分子优化问题

在构造好分子结构以后,我们开始优化分子结构.

那么优化分子结构的时候要不要带上模拟盒,是先加上模拟盒在优化还是优化后

再加模拟盒.
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saitou

木虫 (正式写手)


小红豆(金币+1,VIP+0):不错。
我认为一步步来比较好,先单独优化,然后再加周期边界、溶剂、缩放==,每步是否都要优化似乎要视具体情况而定,不过优化多了总没坏处
不抛弃,不放弃
2楼2008-05-05 18:22:01
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coolter2001

银虫 (小有名气)

谢谢楼上的 
3楼2008-05-06 09:51:42
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saitou

木虫 (正式写手)

不客气。我用的是MS套装,跟你研究的方向也不同。
若是初涉此行,需要横向增长一下见识,触类旁通
不抛弃,不放弃
4楼2008-05-06 11:19:05
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