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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » EST序列如何进行功能分类
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plcl001

银虫 (小有名气)

[交流] EST序列如何进行功能分类

现得一组SSH EST序列,需依功能进行分类,但不知如何来做,请教各位大侠,请不吝赐教!
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1楼 2008-05-04 23:49:30
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plcl001

银虫 (小有名气)
大侠呢?快来华山论剑!
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2楼2008-05-06 08:26:38
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
首先对每一条EST进行annotation，然后根据其putative function进行聚类

或者可以先根据sequence similarity进行聚类
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
3楼2008-05-21 17:06:42
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
xyklmu(金币+4,VIP+0):感谢答复
先根据sequence similarity 搭建 contigs，然后对每一组contig进行function annotation
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
4楼2008-08-27 08:37:40
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longfeng

金虫 (小有名气)
请问一下，具体用什么软件操作？
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5楼2008-08-27 10:56:44
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yuyixst

木虫 (正式写手)
DNASTAR或者vector...
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6楼2008-08-27 11:24:50
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