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superlogj

铜虫 (小有名气)

[求助] Multiwfn作NCI分析导入到vmd作图,C和Cl始终同色

如题,按照Sobereva大神的方法,用multiwfn做nci分析之后,导出func1.cub和func2.cub。导入vmd之后发现碳和氯的颜色始终是一样的,在color里面找不到cl原子,改c的颜色,cl原子颜色会跟着变。求指教。

vmd里面的参数如下:
mol new func1.cub
mol addfile func2.cub
mol delrep 0 top
mol representation CPK 1.0 0.3 18.0 16.0
mol addrep top
mol representation Isosurface 0.50000 1 0 0 1 1
mol color Volume 0
mol addrep top
mol scaleminmax top 1 -0.04 0.02
color scale method BGR
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


再单独创建一个显示方式(点create rep),selected atom里面输入element Cl,然后coloring method设color ID并且设为指定的颜色,并且把原子球稍微设大一点盖过之前的Cl的原子球即可。
2楼2014-10-19 20:41:43
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