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| MarinLit is the premier database for marine natural products research. The database contains comprehensive bibliographic information for published articles related to all aspects of marine natural products. The unusual genesis of this database, originally designed as an in-house system in the 1980s to fulfil the needs of the University of Canterbury Marine Group, led to features that are unique, or seldom found in other chemistry databases. These features, in addition to complete bibliographic details, include: taxonomy, ecology, biogeography, key words, and for compounds, structures, trivial names, syntheses, biosyntheses, bioactivities and NMR and UV data. In addition to easy access to these indexed data for the individual compounds, MarinLit is a very powerful dereplication tool. There are two aspects to this. The first is biogeography. The availability of collection site and depth data gives spatial answers to all possible search profiles. Additionally, all compounds (23,500) in the database have been analysed by a unique algorithm that populates 44 individually searchable fields with the numbers of each structural feature that can be readily recognised by 1H-NMR spectroscopy. This presentation will describe the unique functionality and searching capability of the database, the editorial process, and demonstrate how it can be used to aid dereplication in a research environment. |
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【答案】应助回帖
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RXMCDM: 金币+1, 多谢应助！ 2014-10-12 08:27:54
bxzc123: 金币+50, 翻译EPI+1, ★★★★★最佳答案 2014-10-12 09:07:50
RXMCDM: 金币+1, 多谢应助！ 2014-10-12 08:27:54
bxzc123: 金币+50, 翻译EPI+1, ★★★★★最佳答案 2014-10-12 09:07:50
| MairnList是第一个为海洋自然物质研究设置的数据库，这个数据库包含所有和海洋物质相关的出版书目。这个数据库的建立有一个传奇的开端，在20世纪80年代，他最初是为满足坎特伯雷大学海洋系的需求而设计的一个内部系统，主要收集一些独一无二，或者其他化学数据库中没有记录的物质（的数据），另外，对于数目细节方面包括：分类学、生态学、生物地理学、关键词以及化合物成分、结构、俗名、合成以及生物合成、生物活性和核磁共振波谱以及光谱分析数据。除了容易获取单个化合物的索引数据外，MairnList还是一个非常权威的反复制（dereplication应该是个专业术语，根据产品的结构特点分析出蛋白质序列，再反过来推出RNA序列或者DNA序列）工具，对此有两方面的努力，首先对于生物地理学数据，能够详细的列出所有可能检索到的文件的采集地址和深度数据。另外，在这个数据库中的的所有化合物（23500种）都通过一个特殊的算法进行了分析，这个算法包涵由能够被1H-NMR谱轻易识别的结构特点的数目组成的44个独立搜索领域。这个简介将描述这个数据库的独特性和可检索性以及他的编辑过程，同时展示其在研究环境下为什么能够对反复制工作进行帮助。 |
2楼2014-10-12 01:53:17