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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS跑动力学中的晶胞优化问题
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-09 17:17:50
因为没有做晶胞方面的，所以不是很清楚。感觉Minimizer是一个能量最小化的过程，然后的Dynamics是你设定的具体的模拟过程，在Dynamics的时候，晶胞应该按照你设置的条件进行“优化”，不过觉得用优化这个词不太合适 ...

你这么说我想起一个问题，如果选择NVT系综，固定体积，晶胞自然就不能改变了；如果用NPT系综，晶胞就可以改变尺寸，就相当于优化晶胞了。
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奋斗中的小木虫
11楼2014-10-09 18:38:31
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CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by mengsk at 2014-10-09 18:38:31
你这么说我想起一个问题，如果选择NVT系综，固定体积，晶胞自然就不能改变了；如果用NPT系综，晶胞就可以改变尺寸，就相当于优化晶胞了。...

对于某些无定型的体系是这样的，但是针对晶胞的话就不清楚了，sorry。
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逆风奔跑。
12楼2014-10-09 19:05:55
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-09 19:05:55
对于某些无定型的体系是这样的，但是针对晶胞的话就不清楚了，sorry。...

13楼2014-10-09 22:06:41
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-09 14:36:20
弱弱的问一句，文献里面是用什么方法控温的，温度有点高哦

Andersen, Berendsen两种温控方法有什么区别？
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奋斗中的小木虫
14楼2014-10-10 10:01:38
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CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by mengsk at 2014-10-10 10:01:38
Andersen, Berendsen两种温控方法有什么区别？...

不晓得哦，正是我要探索的问题
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逆风奔跑。
15楼2014-10-10 10:34:00
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