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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS跑动力学中的晶胞优化问题
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mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] MS跑动力学中的晶胞优化问题 已有1人参与

想计算一下聚合物的晶体结构，取了几个重复单元作为晶胞，用MS/discover跑一下动力学，看一下晶胞参数。
有个问题：
晶胞参数只能在能量最小化Minimizer过程中优化吗？跑开动力学Dynamics能否继续优化呢？
看文献中优化了晶胞，不知道是在能量最小化还是动力学过程中优化的？请高手指教一下，谢谢哈！

MS跑动力学中的晶胞优化问题
无标题.jpg
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奋斗中的小木虫
1楼 2014-10-08 11:20:45
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-09 17:17:50
因为没有做晶胞方面的，所以不是很清楚。感觉Minimizer是一个能量最小化的过程，然后的Dynamics是你设定的具体的模拟过程，在Dynamics的时候，晶胞应该按照你设置的条件进行“优化”，不过觉得用优化这个词不太合适 ...

你这么说我想起一个问题，如果选择NVT系综，固定体积，晶胞自然就不能改变了；如果用NPT系综，晶胞就可以改变尺寸，就相当于优化晶胞了。
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奋斗中的小木虫
11楼2014-10-09 18:38:31
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mengsk

金虫 (著名写手)
怎么没人回复啊？急求啊！
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奋斗中的小木虫
2楼2014-10-09 14:27:09
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CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)
弱弱的问一句，文献里面是用什么方法控温的，温度有点高哦
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逆风奔跑。
3楼2014-10-09 14:36:20
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-09 14:36:20
弱弱的问一句，文献里面是用什么方法控温的，温度有点高哦

200摄氏度高吗？做退火模拟的上4-5百度很正常。
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奋斗中的小木虫
4楼2014-10-09 16:09:47
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