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dnp

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小木虫浪子

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[交流] [求助]LC-MSMS得到的蛋白质数据搜库的问题

大家好,请问做蛋白质组研究的虫子们,在你们用LC-MS/MS搜库时,用的如果是Biowork的Sequest搜索时,你们是如何知道这个蛋白质二级质谱的电荷的?是SEQEST里面自己可以设置的?还是他里面有个选项如:+1,+2,+3,然后再搜的?

另外请问用Mascot搜库的虫子,也是如何确定电荷?对于二级质谱是用的什么文件搜的?

每个问题5个bb,恳请的大家的帮助,谢谢……
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