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[求助] 一个有关数据后处理的问题-如何统计衬底上量子点密度

本人刚开始学习分子模拟。最近看到一个模拟量子点生长的教程,附件图是一个结果示例。
教程中算出了量子点密度的变化趋势,但没有提密度是怎么得到的。
请高手指点一下,给定整个体系的坐标文件,有什么软件或方法可以得到点密度?这里假定衬底光滑,且量子点没有覆盖整个衬底(thickness < 1 layer)
先谢谢了!

一个有关数据后处理的问题-如何统计衬底上量子点密度
quantum dot.jpg
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