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不明觉厉

金虫 (小有名气)

[交流] 本人做无机材料合成的,想学点计算然后结合DFT理论做做材料性质,各位支支招

本人方向是无机材料的,第一原理的门外汉,计算化学方面基础零,就是学来用用......最近在研究MS里面的castep,毕竟MS的castep似乎比其他的容易上手。主要还是做band gap、DOS的计算,还打算做电子密度、吸收、漫反射光谱计算(这个可以跟合成后的表征直接比较)。

感觉Ms的castep界面比较人性化
但是目前流行的还有vasp、wien2k什么的

有几个问题想问一下,希望各位帮忙解惑:
1. 几个流行的第一原理软件是互补作用?还是用好其中一个,其他可以不管了?
例如castep模块跟其它相比会不会缺了什么重要功能,或者其本身的缺点相比于其他同类软件较大之类的。

2. 几个流行软件的运算速度、计算质量、用户评价:
有没有哪个快哪个慢、或者哪个好哪个不好这样的说法?
用户评价总该有吧?求推荐呀

3. 使用MS的时候发现有叫做dmol3、dftb+的模块,从界面上看长得很像castep,也能计算band gap之类的,dftb+/dmol3/castep之间是什么关系,这是怎么回事,求说明?
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hn19870519

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
做实验的做计算,精力真的很好啊。做计算不是简单的鼠标点几下,或者送一个命令上去就可以了。楼主保重
3楼2014-10-07 08:54:59
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主你好!
能够想到独辟蹊径进行实验,可喜可贺!
1.不知你学习到了哪个阶段?硕士or博士?或其它?
2.在无机材料合成方面取得的成果如何?
我觉得这些问题都要考虑一下,毕竟千招会不如一招熟!
理论计算很有意思!
4楼2014-10-07 09:27:35
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fflouis

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不明觉厉: 金币+5, 感谢意见~!vasp 2014-10-07 13:19:33
MS的精度是不够的,最终还是要用VASP,这也是为什么vasp在linux下面仍然很热的原因。
5楼2014-10-07 09:33:02
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不明觉厉

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by diyiyuanli at 2014-10-07 09:27:35
楼主你好!
能够想到独辟蹊径进行实验,可喜可贺!
1.不知你学习到了哪个阶段?硕士or博士?或其它?
2.在无机材料合成方面取得的成果如何?
我觉得这些问题都要考虑一下,毕竟千招会不如一招熟!

刚升博,换了课题组但是方向不变,做无机材料合成表征,具体点就是发光材料,荧光粉。
对自己的方向算比较熟了,毕竟发了几篇sci
我留意到,在我的方向里面,最top的同行逐渐开始把手伸向DTF,而目前他们在这方面做的水平并不难跟上。
7楼2014-10-07 12:38:24
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不明觉厉: 金币+5, 非常感谢,很详细。看来无机晶体还是castep好了。我还是由ms开始再往其他软件慢慢推进吧。可惜系统设定只能再放5金币... 2014-10-08 00:04:09
引用回帖:
10楼: Originally posted by 不明觉厉 at 2014-10-07 18:22:25
我说发了paper的意思是,我在材料方面不是一无所知的门外汉,没别的意思了
课题组没做这个所以一无所有
就拿自己的电脑跑而已,最近跑过一些晶体,一些结果比较理想,一些不怎么样。感觉家用机跑D版也能跑得动, ...

我希望在论坛里咱们可以畅所欲谈,不必拘束。有问题的可以一针见血地指出,不必含含糊糊。这样对我们的学习、研究均有所帮助的。当然,自己知道的尽量告知别人。
1. 几个流行的第一原理软件是互补作用?还是用好其中一个,其他可以不管了?
答:现在做理论计算的软件主要有:MS VASP Gauss Wien2K Siesta。他们并不能简单地称之为互补的关系,因为软件基于的原理不同,或者适用的范围也不同。有时候也会考虑计算的时间、计算精度等。

2. 几个流行软件的运算速度、计算质量、用户评价:有没有哪个快哪个慢、或者哪个好哪个不好这样的说法?用户评价总该有吧?求推荐呀!
答:所谓的运算速度本质上讲取决于硬件条件。当然,和你需要达到的精度也有很大的关系。MS集成度比较高、模块化,可以在Windows环境下方便地操作。但缺点也很明显,精度相对要低一些。

3. 使用MS的时候发现有叫做dmol3、dftb+的模块,从界面上看长得很像castep,也能计算band gap之类的,dftb+/dmol3/castep之间是什么关系,这是怎么回事,求说明?
答:MS中的CASTEP基于平面波赝势的方法,用于周期性体系。当然,对于二者的区别及使用,可以参考创腾公司的培训材料。其实三者之间的关系没有必然的联系,设计人员之所以开发出不同的模块是针对不同的用户计算不同的体系。所以在选择一个模块之前因该知道:(1)计算的体系 (2)要应用哪些参数得到怎样的结果 (3)最好能够找到相关的文献用以参考。

对于单机用户,首选MS。应该注意的是:参数特别是函数的选择。
理论计算很有意思!
11楼2014-10-07 21:46:25
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飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用你自己的电脑跑castep. 建议你彻底放弃

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
快乐吧
13楼2014-10-10 23:03:19
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飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不明觉厉: 金币+5 2014-10-15 16:19:57
引用回帖:
14楼: Originally posted by 不明觉厉 at 2014-10-14 01:36:40
能解释原因吗?
(我只需要计算最简的super cell,然后主要计算dos和带隙,最多加上光学性质的吸收和反射)...

castep需要很大的内存,你这样又慢甚至可能无法胜任,对笔记本也是很大的损坏。
快乐吧
16楼2014-10-14 15:02:53
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普通回帖

子子丘水

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不明觉厉: 金币+5, 感谢意见~! 2014-10-07 12:24:40
个人认为MS作为是集大成者,你要比较某一个模块的话,就看一下这个模块使用的哪种算法,该种算法是否符合目前的计算体系就可以了。但是我个人还是推荐MS,界面简洁,功能也很强大!
交流!分享!共赢!
2楼2014-10-07 08:15:59
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不明觉厉

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hn19870519 at 2014-10-07 08:54:59
做实验的做计算,精力真的很好啊。做计算不是简单的鼠标点几下,或者送一个命令上去就可以了。楼主保重

做完实验光是反应都得反应半天,周而复始,时间很多呢
6楼2014-10-07 12:28:35
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不明觉厉: 金币+5 2014-10-07 18:17:19
引用回帖:
7楼: Originally posted by 不明觉厉 at 2014-10-07 12:38:24
刚升博,换了课题组但是方向不变,做无机材料合成表征,具体点就是发光材料,荧光粉。
对自己的方向算比较熟了,毕竟发了几篇sci
我留意到,在我的方向里面,最top的同行逐渐开始把手伸向DTF,而目前他们在这方面 ...

做材料的发几篇SCI不算什么
这是一个兴趣的问题,还要结合课题组的实际。你们的课题组有服务器吗?配置怎么样?
理论计算很有意思!
8楼2014-10-07 15:43:34
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9楼2014-10-07 15:52:12
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不明觉厉

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by diyiyuanli at 2014-10-07 15:43:34
做材料的发几篇SCI不算什么
这是一个兴趣的问题,还要结合课题组的实际。你们的课题组有服务器吗?配置怎么样?...

我说发了paper的意思是,我在材料方面不是一无所知的门外汉,没别的意思了
课题组没做这个所以一无所有
就拿自己的电脑跑而已,最近跑过一些晶体,一些结果比较理想,一些不怎么样。感觉家用机跑D版也能跑得动,就这个水平
我也不打算做的深,同行也有跑跑这个的,我看别人也就停留在band gap,掺杂引起光谱变化。

最后,请回答我的问题......
10楼2014-10-07 18:22:25
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