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tianpingpe

新虫 (小有名气)

[求助] 利用swiss-model建模后,模型无法利用ds对接fmn

我利用swiss-model建模,模板蛋白与我的蛋白同源性为45%,因我的目的蛋白,此家族酶fmn与其非共价结合,利用ds无法成功对接fmn,只有成功对接fmn后我才能对接我的底物,单独利用此pdb可以与底物对接,fmn对接始终失败,不知道是什么原因,活性位点我是选择了的。不知道是软件问题,还是我的方法有问题,请求高手告知我fmn对接进入蛋白的方法,其他软件也可以?谢谢!
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


你可以同源建模的时候,把FMN在模型里,这样就不用重新对接FMN了
2楼2015-06-04 09:33:31
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