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tianpingpe

新虫 (小有名气)

[求助] 利用swiss-model建模后，模型无法利用ds对接fmn

我利用swiss-model建模，模板蛋白与我的蛋白同源性为45%，因我的目的蛋白，此家族酶fmn与其非共价结合，利用ds无法成功对接fmn，只有成功对接fmn后我才能对接我的底物，单独利用此pdb可以与底物对接，fmn对接始终失败，不知道是什么原因，活性位点我是选择了的。不知道是软件问题，还是我的方法有问题，请求高手告知我fmn对接进入蛋白的方法，其他软件也可以?谢谢！
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1楼 2014-10-03 16:37:00
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)
你可以同源建模的时候，把FMN在模型里，这样就不用重新对接FMN了
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2楼2015-06-04 09:33:31
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