应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 计算扩散系数
313/4返回列表上一页1234下一页
查看: 7182  |  回复: 30
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
21楼2015-12-28 10:18:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
22楼2016-01-04 22:32:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
23楼2016-01-05 09:16:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
24楼2016-01-10 14:28:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
25楼2016-01-10 23:12:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
26楼2016-01-11 09:03:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Awcse

新虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by lsloneil at 2015-12-22 23:33:22
可以，前提是你有合适的力场。

锂离子在电极材料中的扩散和其他普通离子在溶液中的扩散的最大区别是：锂离子的扩散实质上是化学反应。在这种情况下，需要专门的力场（反应性力场或者根据量子化学计算拟合的力场 ...

感谢您的回复，我做的是第一性原理的vasp，模拟的体系较小，现在遇到了生成的数据不会处理的问题，XDATCAR保留了每一步模拟的结构我想根据这个结构的数据求出他的MSD不知道您是否知道有哪些软件可以做这个事情
赞一下 回复此楼
27楼2016-01-12 09:24:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青大柯尔斯滕

新虫 (正式写手)
你好，我想请问一下，跑分子动力学的时候，240K的初试结构是不是应该是230K的最后一帧？还是说优化过了的结构可以直接进行不同温度下的分子动力学的模拟？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
28楼2016-04-25 17:47:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

韩旭辉

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lsloneil at 2014-10-01 13:25:26
聚合物中如果有孔洞的话，严格意义上来讲粒子在孔洞中的扩散是受限的。所以会出现粒子长时间只在某个区域的孔洞中运动的情况，这样的话如果你从不同的初始条件开始而采样时间不够长的话，采集到的MSD只是粒子在某个 ...

你好，我想问一下，关于没时间的问题，我也是扩散系数，体系比较小，几千个分子，我之前分别跑了200ps和300ps，如果我想要跑到1ns的话是不是再跑500ps就可以了，还是要重新跑1ns啊？
赞一下 回复此楼
NAFION
29楼2016-04-25 21:18:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
29楼: Originally posted by 韩旭辉 at 2016-04-25 01:18:39
你好，我想问一下，关于没时间的问题，我也是扩散系数，体系比较小，几千个分子，我之前分别跑了200ps和300ps，如果我想要跑到1ns的话是不是再跑500ps就可以了，还是要重新跑1ns啊？...

如果你300 ps的轨迹是接着你的200 ps的轨迹，那么可以接着你的300 ps的轨迹再跑500 ps.
赞一下 回复此楼
30楼2016-04-25 23:13:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 敏sunflower 的主题更新
313/4返回列表上一页1234下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 CyTWnZiM0cS6 2026-08-02 5/250 2026-08-02 20:43 by 3VGOm6paSgqv
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 9/450 2026-08-02 20:32 by 3VGOm6paSgqv
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 5/250 2026-08-02 20:31 by 3VGOm6paSgqv
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 7/350 2026-08-02 20:24 by 3VGOm6paSgqv
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 8/400 2026-08-02 20:24 by 3VGOm6paSgqv
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 6/300 2026-08-02 20:21 by 3VGOm6paSgqv
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 12/600 2026-08-02 20:21 by drbart
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 7/350 2026-08-02 20:11 by 3VGOm6paSgqv
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 13/650 2026-08-02 20:04 by 3VGOm6paSgqv
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 17/850 2026-08-02 19:58 by 3VGOm6paSgqv
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 17/850 2026-08-02 19:54 by 3VGOm6paSgqv
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 21/1050 2026-08-02 19:52 by 3VGOm6paSgqv
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 9/450 2026-08-02 18:27 by ca3DVAx4OB19
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 15/750 2026-08-02 16:23 by jHcrHMhbKCFV
[教师之家] 基础研究怎么拉横向，学校到款任务越来越多，难以完成 拉横向，都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 10/500 2026-08-02 10:00 by 锦衣卫寒战
[考博] 2027年申博 50+3 射雕英雄胜 2026-07-30 3/150 2026-08-02 09:36 by lfy8008
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液，是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了，估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭