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wang-lf09

木虫 (小有名气)

[求助] 求问β-Keratin的具体分子结构 已有1人参与

最近搞计算要用到β-Keratin的分子结构，但我非生物专业，对这个不了解，所以烦请知道的朋友告知，能有具体文献或其他信息来源就更好了。或者告诉一下哪能查到一些常见蛋白质或生物组成的具体结构。先谢谢了！
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1楼 2014-09-26 09:42:19
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
β-Keratin是β-角蛋白吧，不同物种的会不同，你到NCBI的structure里搜Keratin就有了。如果你有序列，那可以先blast，然后根据结果找结构，相关的文献也会有链接。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?uid=100661
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2楼2014-09-26 11:19:34
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wang-lf09

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-09-26 11:19:34
β-Keratin是β-角蛋白吧，不同物种的会不同，你到NCBI的structure里搜Keratin就有了。如果你有序列，那可以先blast，然后根据结果找结构，相关的文献也会有链接。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdb ...

谢谢您！给我提供了重要的信息，但我还是有点不懂。
我看您给我提供的这个角蛋白分子结构里大概含有三千多个原子，这对我来说有点大呀，而且我看了一下好像其他种类的也都比较大。
我主要关心壁虎脚上刚毛的主要成分β-角蛋白，不知道能否查到它的分子结构，最好是小点的，谢谢您哈！
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3楼2014-09-26 15:02:44
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wang-lf09 at 2014-09-26 15:02:44
谢谢您！给我提供了重要的信息，但我还是有点不懂。
我看您给我提供的这个角蛋白分子结构里大概含有三千多个原子，这对我来说有点大呀，而且我看了一下好像其他种类的也都比较大。
我主要关心壁虎脚上刚毛的主要 ...

网站里给出的就是一个角蛋白的分子结构！蛋白质一般都是大分子，100来个氨基酸、3000多个原子算小的了。我虽然不知道你说的那个的序列是什么样的，但它应该也有这么多原子，同源蛋白有一定相似性的。顺便提一句，生物领域和传统的化学领域有些不同，生物领域的几大类基础物质如蛋白、脂类和多糖等等都是大分子，一个分子里有几千个原子不算多的。
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4楼2014-09-26 15:17:22
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wang-lf09

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-09-26 15:17:22
网站里给出的就是一个角蛋白的分子结构！蛋白质一般都是大分子，100来个氨基酸、3000多个原子算小的了。我虽然不知道你说的那个的序列是什么样的，但它应该也有这么多原子，同源蛋白有一定相似性的。顺便提一句，生 ...

嗯，谢谢您，您帮了我很大忙，看来是都比较大。
有没有简化的方法呢？得到小体系的，但也具有代表性的。
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5楼2014-09-28 08:49:16
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wang-lf09 at 2014-09-28 08:49:16
嗯，谢谢您，您帮了我很大忙，看来是都比较大。
有没有简化的方法呢？得到小体系的，但也具有代表性的。...

对某些研究得比较透彻的蛋白是可以简化的，不过这类蛋白很少。一个功能蛋白中有很多氨基酸，其中大部分氨基酸是起辅助作用的，比如构成和稳定三维结构、稳定活性位点等，只有少数氨基酸负责执行整个蛋白的主要功能，这少数氨基酸就是通常所说的活性位点。但是，要确定这些少数氨基酸并不是一件容易的事，往往需要好几年甚至十几年的研究，有时候花上十几年也搞不明白的也很正常。你可以多找一些有关这个蛋白的论文，研究得比较透彻的蛋白会有深入的分析，这个就看你的运气了。
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6楼2014-09-28 09:11:40
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