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wang-lf09

木虫 (小有名气)

[求助] 求问β-Keratin的具体分子结构 已有1人参与

最近搞计算要用到β-Keratin的分子结构,但我非生物专业,对这个不了解,所以烦请知道的朋友告知,能有具体文献或其他信息来源就更好了。或者告诉一下哪能查到一些常见蛋白质或生物组成的具体结构。先谢谢了!
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
β-Keratin是β-角蛋白吧,不同物种的会不同,你到NCBI的structure里搜Keratin就有了。如果你有序列,那可以先blast,然后根据结果找结构,相关的文献也会有链接。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?uid=100661
2楼2014-09-26 11:19:34
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wang-lf09

木虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by liuderong at 2014-09-26 11:19:34
β-Keratin是β-角蛋白吧,不同物种的会不同,你到NCBI的structure里搜Keratin就有了。如果你有序列,那可以先blast,然后根据结果找结构,相关的文献也会有链接。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdb ...

谢谢您!给我提供了重要的信息,但我还是有点不懂。
我看您给我提供的这个角蛋白分子结构里大概含有三千多个原子,这对我来说有点大呀,而且我看了一下好像其他种类的也都比较大。
我主要关心壁虎脚上刚毛的主要成分β-角蛋白,不知道能否查到它的分子结构,最好是小点的,谢谢您哈!
3楼2014-09-26 15:02:44
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wang-lf09 at 2014-09-26 15:02:44
谢谢您!给我提供了重要的信息,但我还是有点不懂。
我看您给我提供的这个角蛋白分子结构里大概含有三千多个原子,这对我来说有点大呀,而且我看了一下好像其他种类的也都比较大。
我主要关心壁虎脚上刚毛的主要 ...

网站里给出的就是一个角蛋白的分子结构!蛋白质一般都是大分子,100来个氨基酸、3000多个原子算小的了。我虽然不知道你说的那个的序列是什么样的,但它应该也有这么多原子,同源蛋白有一定相似性的。顺便提一句,生物领域和传统的化学领域有些不同,生物领域的几大类基础物质如蛋白、脂类和多糖等等都是大分子,一个分子里有几千个原子不算多的。
4楼2014-09-26 15:17:22
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wang-lf09

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-09-26 15:17:22
网站里给出的就是一个角蛋白的分子结构!蛋白质一般都是大分子,100来个氨基酸、3000多个原子算小的了。我虽然不知道你说的那个的序列是什么样的,但它应该也有这么多原子,同源蛋白有一定相似性的。顺便提一句,生 ...

嗯,谢谢您,您帮了我很大忙,看来是都比较大。
有没有简化的方法呢?得到小体系的,但也具有代表性的。
5楼2014-09-28 08:49:16
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wang-lf09 at 2014-09-28 08:49:16
嗯,谢谢您,您帮了我很大忙,看来是都比较大。
有没有简化的方法呢?得到小体系的,但也具有代表性的。...

对某些研究得比较透彻的蛋白是可以简化的,不过这类蛋白很少。一个功能蛋白中有很多氨基酸,其中大部分氨基酸是起辅助作用的,比如构成和稳定三维结构、稳定活性位点等,只有少数氨基酸负责执行整个蛋白的主要功能,这少数氨基酸就是通常所说的活性位点。但是,要确定这些少数氨基酸并不是一件容易的事,往往需要好几年甚至十几年的研究,有时候花上十几年也搞不明白的也很正常。你可以多找一些有关这个蛋白的论文,研究得比较透彻的蛋白会有深入的分析,这个就看你的运气了。
6楼2014-09-28 09:11:40
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