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MS-LAMMPS
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| 初始构型是用MS构建的晶胞,通过AC模块之后,导出坐标键角等信息运行LAMMPS,但是由于是聚合物长链,有很多原子处于盒子边界外面(由于预设密度,盒子体积一定),所以运行LAMMPS时出错,Bond atoms %d %d missing on proc %d at step %ld(cutoff是根据文献设定的),或者Out of range atoms - cannot compute PPPM(neigh_modify命令已用。请问处于盒子外面的原子该如何处置呢,试过nvt和npt都不行 |
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小讨厌123
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2楼2015-11-15 14:20:01













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