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zuozhijun5134

至尊木虫 (文坛精英)

[交流] 【求助】discover提示错误是什么原因?

错误结果如下:
Error: Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION,  5000.000
    invoked from within
"dynamics \
    time = 10000.00 \
    timestep = 1.00 \
    initial_temperature = 1173.00 \
    ensemble = NPT \
    temperature_control_method = ander ..."

Total time used by DISCOVER: 0.63 secs

Completion date: Thu Apr 24 15:04:56 2008
Exiting Discover: An ERROR has occurred!

另一个计算错误的提示结果如下
Error: Energy expression: syntax error in expression "(2.0 * 3.14159) / -1.#IND"
Error: Dynamics: Integrator in dynamics failed
    while executing
"expr (2.0 * $pi) / $vol"
    invoked from within
"set energyFactor [expr (2.0 * $pi) / $vol]..."
    (procedure "fullTailCorrection" line 15)
    invoked from within
"fullTailCorrection 9.50 0"
    invoked from within
"dynamics \
    time = 10000.00 \
    timestep = 1.00 \
    initial_temperature = 1173.00 \
    ensemble = NPT \
    temperature_control_method = ander ..."

Total time used by DISCOVER: 0.83 secs

Completion date: Thu Apr 24 15:05:26 2008
Exiting Discover: An ERROR has occurred!

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 21:00 ]
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yuerainsea


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
第一个是能量太大,可能结构没优化好,可以先把5000,改大些试试
2楼2008-04-24 15:46:04
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qasd

木虫 (著名写手)

第一个体系能量太高,先优化一下
第二个貌似语法错误,把inp文件发上来看看
3楼2008-05-04 23:16:19
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zwprxiantao

银虫 (小有名气)


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢 4-10 23:04
请问楼主问题解决没有?
我也遇到这样的问题。
我是discover可以计算简单结构,当把结构建为超胞后,就出现这样的错误!

而且,超胞之前优化,一直找不到能量汇聚点。。。

我尝试把优化步数增加,也一直有小范围波动。

直接利用discover计算,并将能量偏差增大,也不行。。。
我是一匹狼
4楼2009-03-24 16:27:45
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pumf

木虫 (正式写手)

我也遇到过类似的问题,你可以在用Amorphous 建立无定形晶胞的时候把下面的优化的选项的钩去掉。然后建好以后在进行动力学能力优化。
5楼2009-03-24 19:32:28
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢,欢迎常来 4-10 23:04
如果是用npt,建议先在nvt下面优化;
如果是nvt,建议先进行能量最小化。
6楼2009-03-24 19:37:31
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