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[讨论] 机群cluster下计算的问题
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机群cluster下,CASTEP计算时,top查看CPU占用情况很正常,接近百分百占用,但就是时间很长,比单机计算用的时间都长,一直没有完成信息,其间CPU一直占用着. 大家讨论一下可能的原因. 怀疑是计算完成,但没有正常返回计算结果. 另外大家可以在此贴下提出关于linux下MS计算的相关问题,熟悉的朋友可以帮忙解答. [ Last edited by totem on 2008-4-24 at 12:13 ] |
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这个原因我想到过,查了好几次了.不是这个原因,硬盘才用了10%多一点. 我现在怀疑是我PC也有问题了. 一个任务,在cluster server上,4 core计算机上和单机上都出问题. 晕了. 看看这个提示: **************************************************************************** Warning: electronic minimisation did not converge when finding ground state. **************************************************************************** Writing checkpoint file... Writing model to ***.check Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. Error check_elec_ground_state : electronic_minimisation of initial cell failed. MPI Application rank 2 exited before MPI_Finalize() with status 1 |
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