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spkeey

金虫 (正式写手)

[交流] [求助]移动原点和坐标轴?

怎么把一个原子移动到原点(其他原子相应的也移动)还有xyz坐标轴方向?
不管用哪个软件,给个方法。
Gview中的move center 只是显示上中心,或朝向是一个面,坐标保存不了,chem3D也是一样。
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SPKEEY
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jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
spkeey(金币+2,VIP+0):谢谢,如果要编程的话,我自己搞好了。
移动到原点很简单:

你先计算出整个分子中心的位置:    center_x=sum(x)/n  center_y=sum(y)/n  center_z=sum(z)/n   (n指原子的个数)
接着把所有原子的坐标向量减出这一向量就是了。

接下来就再进行旋转来改变坐标轴,这需要一些矩阵操作,找一找一些课本,一般会给出绕某轴旋转一定角度的矩阵。当然最好的办法是把这些都写成程序。

如果需要的话,把坐标给我,我帮你转换,jjf_sxtu@yahoo.com.cn
3楼2008-04-24 13:25:24
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niliu

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
Gview
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2楼2008-04-24 11:28:01
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huahua1981

铜虫 (小有名气)

楼上的问题很好啊
我现在加电场计算的时候为什么gif文件的电厂方向和out不一样呢
你要是变原点很简单啊 把那个原子的编号变成1就是了
4楼2008-04-25 10:08:53
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jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)

我看错你的问题了,在直角坐标系下,要把某个原子移到原点,就把所有的原子坐标向量都减去这个原子的坐标向量就是了。
5楼2008-04-25 13:57:35
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