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【求助】关于autodock能量评判方面的请教
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autodock最后会给出Docking energy和Binding energy两个结果。 究竟该如何选择这两个数值作为评判指标呢？ 甚至我还有点不解，究竟应该选择最低能量，还是选择若干个run的平均能量作为评判指标呢？ 我个人觉得对于小分子药物选择binding energy，对于相对大分子，torsion比较多的药物比如多肽选用docking energy，这种想法是否合理呢？ 此外，有没有比如说某条及格线，要在多少能量以下，可以认为两者之间有结合的评判标准的？ [ Last edited by superwheat on 2008-4-21 at 13:01 ] |
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