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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】1 MS中怎么加入一个分子/2 内存不足问题
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胭脂。花开

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】1 MS中怎么加入一个分子/2 内存不足问题

请教各位大侠。现在研一刚进实验室，实在不明白很多东西。这里先谢过。
  
1 老板说加入一个分子在UNIT CELL中用动力学跑 一下，机组我都选好了，但怎么加分子实在不知道，且没有勇气问老板。以前没有用过MS，请各位帮帮忙，或者告诉我在哪可以找到也好。


2先没放分子空跑了一下Dmol3,显示内存最少需要1394MB，可是我用的机器是2G的，为什么还报错呢，是不是有可能我其它的地方设置的有问题？


大概是比较弱的问题，大家见笑了。。但我实在是搞不定。。谢谢。。

[ Last edited by lei0736 on 2008-4-19 at 14:42 ]
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1楼 2008-04-19 11:06:21
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sduzsw

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 鼓励新人
有关MS的中文教程也不少，上网上下几篇看看就懂了
另外去创腾科技的网站http://www.neotrident.com/newpage/index.asp也能找到点东西
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2楼2008-04-19 11:54:37
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢指点
1. 最基本的:build-> add atioms,也可以在新的窗口建立好分子后 Ctrl+C,+V复制过去, 再移动. 里面还是有不少技巧性的东西,用多了就好了
2. 报错的内容是什么?而且显示的需要内存有时候也不一定准
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3楼2008-04-19 14:08:37
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胭脂。花开

铁虫 (初入文坛)
谢谢楼上各位了。
  
我试试先建一个分子再插入。因为我用过ADD ATOM 不大会弄。惭愧啊。

报错：我只是知道在那个文件中找到ERROR 后面显示insufficient memory
  然后后面就是最小1394MB。除了内存的原因，还有可能是其它原因吗。。
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4楼2008-04-19 16:00:31
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acridine

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢建议
估计是内存的问题了,是不是体系太大了,多少个原子?
最好简化一下模型,否则即使增加了足够的内存,计算起来也是很慢很郁闷的
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5楼2008-04-19 22:24:24
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胭脂。花开

铁虫 (初入文坛)
一个UNIT CELL四百多个原子。
谢谢楼上的意见。。明天去再试试。。
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6楼2008-04-20 14:25:40
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