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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】amber做动力学的一些问题

在做amber动力学的时候怎样设定内存?同样cpu数目的条件下,是不是内存越大越快?
这套配置做动力学怎样?
CPU:Intel Xeon 5410 2.33G *2

主板:超微 X7DVL-I

内存:金士顿 2GB DDR2 667(ECC FB DIMM) *2

硬盘:500G SATAII企业级

电源:航嘉 磐石 500

机箱:2U

双路的服务器,一共是4G内存,两颗cpu,每颗4核。不知道跑amber做动力学运算怎么样?稳不稳定?
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luai071

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
以我的经验来看,动力学中内存大不是最主要的,主要的还是CPU,楼主你只有8个核,太少了,做一个amber估计得20天以上,呵呵用集群做吧,或者分布式的
2楼2008-04-19 11:20:57
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

那请问,如果我有10台这样的机子,怎样做分布式的计算?
3楼2008-04-19 20:27:38
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小欢

金虫 (正式写手)

内存不是主要因素

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
本人没做过amber,倒是有个朋友做过,据他讲,amber串行计算速度比较慢,不过看到搂主服务器的配置,如果用amber的并行程序,应该很快,而且内存差不多够了,你一个服务器8个核,速度应该比较理想
4楼2008-04-20 11:35:59
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

如果是2G内存,这套配置跑amber够吗?
5楼2008-04-22 10:27:23
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shalene

至尊木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
md对内存要求不高,
6楼2008-04-22 10:40:16
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

如果是2G够吗?
7楼2008-04-25 17:51:30
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zhp1006

银虫 (小有名气)

针对一般大小的体系,应该还是很理想的
8楼2008-09-20 15:31:56
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