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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】如何处理径向分布函数
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abc6394490

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何处理径向分布函数

用Materials Studio软件的Forcite模块做分子动力学模拟后，得到的径向分布函数如何处理？

主要是如何根据图像计算配位数，等待大家回答......................
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1楼 2008-04-17 16:08:03
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 3-21 17:19
是积分，但不是简单的积分，跟你计算RDF的方法有关系。你的RDF是怎样算出来的？

配位数虽然可以用RDF的积分来定义，但是，通常，配位数的计算是在统计RDF的时候就顺便计算了。也就是说，计算过程往往是先统计配位数，再归一化得到RDF的。因为RDF的定义就是离原子多远的地方出现另一个原子的概率。
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14楼2009-03-21 11:12:46
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multiscale

铁虫 (初入文坛)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 鼓励新人 呵呵
g(r)最大峰值即为配位数,对应的r为最可几距离,大家认为呢?
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2楼2008-04-19 16:03:57
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yuerainsea

★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 文献太多了
lei0736(金币+0,VIP+0):去我发的帖子看看电子书吧 关于MD的书都有RDF 尤其最经典的那几本
对,配位数是纵坐标啊
有没有这一类的好的参考书和文献啊
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3楼2008-04-19 19:08:56
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biocheminfo

铁虫 (初入文坛)
好冷清啊，咋没人说话
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4楼2008-04-19 20:47:41
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