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abc6394490

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】构建晶体结构的问题[已解决]

引用回帖:
解决办法:

用ICSD软件的Visualizer查看结构视图,点击File -> Export CIF ,输入 anyname.cif(扩展名是必需的) 保存,切记不要放到带有中文文成的路径中(如桌面等),不然用MS打开时会提示数据格式错误。

在ICSD中查到的数据:
引用回帖:
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Li   1  +1    8 a   0.125       0.125       0.125          1.         0   
Li   2  +1    16 d  0.5         0.5         0.5            0.5        0   
Mg   1  +2    16 d  0.5         0.5         0.5            0.5        0   

Cl   1  -1    32 e  0.25699(2)  0.25699(2)  0.25699(2)     1.         0  

1.在MS中构建晶体结构时Li-2和Mg的位置是一样的,不能添加,怎么办?


还有占有率的问题,为什么改成0.5时这类原子依然占据着所有位置,只是体系中这类原子的数量减半?


还有Cl,根据这个坐标构建的时候,怎么看到面心处像是两个原子重叠在了一起,体心处也有类似问题,
提示信息:
引用回帖:
chose position is within the specified tolerance (1.0) of a summetry copy of it self

或者哪位XDJM帮忙建下,看是不是我做错了,
下面是ICSD中的全部数据:
引用回帖:
*data for   ICSD #74957
CopyRight   ?2005 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
            Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
Coll Code   74957
Rec  Date   1995/10/17
Mod  Date   2003/04/01
Chem Name   Dilithium Magnesium Tetrachloride
Structured  Li2 Mg Cl4
Sum         Cl4 Li2 Mg1
ANX         AB2X4
D(calc)     2.12
Title       Kristallstrukturen von Mg Cr2 O4-Typ, Li2 V Cl4 und Spinell-Typ Li2
            Mg Cl4 und Li2 Cd Cl4
Author(s)   Partik, M.;Schneider, M.;Lutz, H.D.
Reference   Zeitschrift fuer Anorganische und Allgemeine Chemie
            (1994), 620, 791-795
            Phase Transition
            (1992), 38, 127-220
Unit Cell   10.401(2) 10.401(2) 10.401(2) 90. 90. 90.
Vol         1125.19
Z           8
Space Group F d -3 m Z
SG Number   227
Cryst Sys   cubic
Pearson     cF56
Wyckoff     e d a
R Value     .017
Red Cell    F  7.354 7.354 7.354 60 60 60 281.297
Trans Red   0.500 0.500 0.000 / 0.000 0.500 0.500 / 0.500 0.000 0.500
Comments    Stable up to 791 K (2nd ref., Tomaszewski), above Fm3-m
            The structure has been assigned a PDF number: 82-905
            Structure type : Al2MgO4
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Li   1  +1    8 a   0.125       0.125       0.125          1.         0   
Li   2  +1    16 d  0.5         0.5         0.5            0.5        0   
Mg   1  +2    16 d  0.5         0.5         0.5            0.5        0   
Cl   1  -1    32 e  0.25699(2)  0.25699(2)  0.25699(2)     1.         0   
Lbl  Type      U11         U22         U33         U12         U13         U23
Li1  Li1+ 0.028(1)    0.028(1)    0.028(1)    0           0           0           
Li2  Li1+ 0.0185(2)   0.0185(2)   0.0185(2)   -0.0021(3)  -0.0021(3)  -0.0021(3)  
Mg1  Mg2+ 0.0185(2)   0.0185(2)   0.0185(2)   -0.0021(3)  -0.0021(3)  -0.0021(3)  
Cl1  Cl1- 0.01730(5)  0.01730(5)  0.01730(5)  -0.00141(6) -0.00141(6) -0.00141(6)
*end for    ICSD #74957

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-28 at 21:49 ]
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chemofish

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
方法论上,你可以点击该位置上的原子,在property里add另一原子,edit占有率为0.5,然后开始计算.
原则上,很多人反对这样做,因为该0.5是统计结果,而方法论上的则是绝对结果.
2楼2008-04-17 15:01:57
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hopingzmn

金虫 (知名作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
引用回帖:
Originally posted by chemofish at 2008-4-17 15:01:
方法论上,你可以点击该位置上的原子,在property里add另一原子,edit占有率为0.5,然后开始计算.
原则上,很多人反对这样做,因为该0.5是统计结果,而方法论上的则是绝对结果.

说得精辟
如果要达到掺杂的目的,还是不要通过改变占有率的方式。

关于前一个问题,有点奇怪,似乎只能通过改占有率的方式……
淡定
3楼2008-04-17 15:14:09
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abc6394490

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by chemofish at 2008-4-17 15:01:
方法论上,你可以点击该位置上的原子,在property里add另一原子,edit占有率为0.5,然后开始计算.
原则上,很多人反对这样做,因为该0.5是统计结果,而方法论上的则是绝对结果.

呵呵

有点晕

不过大体上可以明白什么意思

这个不应该这样随便吧,如果这样改了计算出的结果会不会有问题?
4楼2008-04-17 15:21:31
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abc6394490

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hopingzmn at 2008-4-17 15:14:

说得精辟
如果要达到掺杂的目的,还是不要通过改变占有率的方式。

关于前一个问题,有点奇怪,似乎只能通过改占有率的方式……

其实我不是要掺杂,只是查到的Li2MgCl4的结构确实是这样的,我是新手,只是在做毕业设计,深入的理论研究是不可能了,所以只能尽量的把结果算出来,精确些,毕竟以后做的事和这没什么关系
5楼2008-04-17 15:32:34
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匿名

用户注销 (著名写手)

本帖仅楼主可见
6楼2008-04-17 16:03:58
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abc6394490

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lirwx at 2008-4-17 16:03:
直接从icsd里面导出试一下

不知道你所说的导出是导出成什么格式的,CIF格式的MS不能打开,其他的我不知道还哪个可用

楼上的兄弟说明白些吧,用哪种格式
7楼2008-04-17 16:23:48
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ocean08

木虫 (著名写手)

做人要开心


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
就用CIF格式
参见http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=745220&fpage=5

[ Last edited by ocean08 on 2008-4-17 at 21:10 ]
以一无所知和无所不知的方式去思考;以即将赴死和永生不死的态度去生活。
8楼2008-04-17 19:17:56
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abc6394490

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ocean08 at 2008-4-17 19:17:
就用CIF格式
参见http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=745220&fpage=5

[ Last edited by ocean08 on 2008-4-17 at 21:10 ]

多谢多谢!!!

解决了,看了那个帖子恍然大悟,我一直把cif文件保存在了桌面上,忽略了桌面的文件夹名称是中文的

开始就想cif文件应该是通用的,不能出现格式错误的提示啊,原来是中文路径问题,切记切记!
9楼2008-04-18 11:28:45
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