应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 有SNP的rs号，如何查找其在cDNA上的位置？
51/1返回列表
查看: 2441  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dongyan08

木虫 (正式写手)

[求助] 有SNP的rs号，如何查找其在cDNA上的位置？ 已有3人参与

各位大侠：
            我查到了某位点的SNP号，也就是rs......，那么我要知道这个rs......是对应在cDNA序列上的什么位置我该怎么查呢？第一次查这东西，不懂，请赐教啊！！
            另外，我查到其NM_024675.3:c.2586+58C>T这又是什么意思？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-08-24 10:36:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alvmei

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 西苑前 at 2015-01-31 17:49:29
c.2586+58C>T表示该位点在CDS序列上第2586个碱基之后的内含子区域中，往后数58个就是了

你好，请问你知道怎么查一个SNP位于cDNA或者gDNA中的位置吗（SNP location numbering is heterogeneous should be either cDNA or gDNA positions）？该怎么查？我的SNP是POR 6593A>G(rs2868177),该怎么按照前面的英文写呢？好不容易找到了这个帖子，麻烦知道的前辈多指点指点！！
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-25 23:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-08-24 20:12:58
1，把CDNA拷贝出来，到NCBI网站比对，获得基因全序列，,
2，把你发现的SNP两端序列拷贝出来，跟基因全长比对就行了。
赞一下 回复此楼
2楼2014-08-24 11:46:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1297286362

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-11-05 09:44:00
在NCBI上的all database 的下拉菜单中选择SNP 输入rs号后点search，再点最上边的rs号，在Integrated Maps中点击最上边的那一栏（那是最新出来的），再在右上角点tools的下拉菜单中的sequence text view，再和NCBI上直接找到的DNA序列进行比对。
NM指的是mRNA
赞一下 回复此楼
喜欢你就诅咒你！
3楼2014-11-04 21:51:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西苑前

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-02-02 10:56:53
c.2586+58C>T表示该位点在CDS序列上第2586个碱基之后的内含子区域中，往后数58个就是了
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-31 17:49:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:31 by L135790
[考研] 0854复试调剂 276 +3 wmm9 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:13 by 热情沙漠
[考研] 0856调剂 +5 刘梦微 2026-02-28 5/250 2026-03-01 22:30 by wang_dand
[考研] 材料类求调剂 +10 wana_kiko 2026-02-28 12/600 2026-03-01 22:10 by 海嵙Y
[考研] 0805总分292，求调剂 +7 幻想之殇 2026-03-01 7/350 2026-03-01 21:22 by 公瑾逍遥
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +5 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:47 by 无际的草原
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考博] 26申博 +4 想申博！ 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博！
[考研] 290求调剂 +9 材料专硕调剂； 2026-02-28 11/550 2026-03-01 17:21 by sunny81
[考研] 化工专硕342，一志愿大连理工大学，求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[基金申请] 刚录用，没有期刊号，但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +3 gaoxiaoniuma 2026-02-28 4/200 2026-03-01 14:30 by jjj三跨
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭