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chenjingzhi金虫 (小有名气)
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关于martyna版nose-hoover控温控压方法
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| 在martyna的1996年的论文“Explicit reversible integrators for extended system dynamics”里面提到过,如果要使用这种刘维尔形式的方法进行控温控压的话,那么分子的构形保持算法,如SHAKE、RATTLE,就得进行更改,但是论文里面所提出的受限算法却是由上述的两种混合组成的,第一步(这里使用的是velocity-verlet积分方法)使用SHAKE进行控制,与nose-hoover chain相结合,循环直至得到的受限因子能够使nose-hoover chain操作后的粒子间位置满足键长要求,接着是第二步移动,过程与第一步相似,但是这里使用的却是RATTLE算法,到底这是怎么一回事,是我理解有问题吗。我也找过其他相关的论文,却发现他们给这种构形保持算法取名为ROLL算法,那么说似乎的确与SHAKE和RATTLE不同。求指点。 |
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chenjingzhi
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