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[求助]
关于MS吸附模拟中遇到的几个问题，希望各位前辈能给予解答
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小弟初学MS，看了一段时间教程，可是原来不是做这方面的，现在老板让做分子筛吸附气体的模拟，上手起来进度缓慢，好多专业名词都不了解，找了一篇做分子筛吸附CO2的文献，想按照文中的步骤试着做一下，边做边学。在模拟过程中有些问题不太明白，希望有前辈能给予指导和解答，先在此谢过了。 1.吸附剂为13X-APG，文献中是用的MS中自带的FAU结构，然后进行修改，FAU （Al96 Si96 O384）,13X-APG为Na86 Al86 Si106 O384，因此需要将结构中的10个Al替换为Si，并加入86个Na。文献中替换的是5个特定位置的Al，正反面各5个。请问为什么要替换这5个位置的Al，遵循的是什么规则？ 2.向结构中加入86个Na原子，是把Na当做吸附质，结构当做吸附剂，使用sorption中的locate来做，请问这样做正确吗？设置与吸附后结构如下图 3.吸附完成后使用Forcite进行结构优化，设置如下图，请问这样做是否正确，还有这个结构优化的原理是什么，要达到一个什么目的。 4.在forcite优化完成后还要进行Dmol3计算吗，ESP电荷是起到什么作用的，这里不理解。文献中3个簇模型原子电荷是干什么用的。 暂时是这些不理解的地方，初学MS，原来也从未接触过这方面的知识，学起来感觉一头雾水，十分迷茫。希望各位前辈能给一个吸附模拟的大体脉络，要进行哪些步骤，入门有哪些书推荐看一下，能对这些基础理论有个了解，MS中的各模块具体的作用是干什么的，教程中写的太简略，只知道他们的字面作用，却根本不知道该什么时候用，怎么用。希望各位不吝赐教，万分感激！  捕获1.PNG [ Last edited by 月只蓝 on 2014-8-19 at 09:12 ] |
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