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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 过渡态构型
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guobinwang

金虫 (小有名气)

[求助] 过渡态构型已有1人参与

最近在搜寻一个过程的过渡态，搜寻出来后发现过渡态的构型和末态的构型看着非常相似，也就是键长和键角上有差别。但是通过频率验证，过渡态构型确实有虚频，及这个构型确实是过渡态。现在想请教一下这样的话这个过渡态可用吗？请各位大神给出宝贵意见。谢谢！！
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空中雄鹰，陆地猛虎，水中蛟龙
1楼2014-08-16 09:30:10
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gauss98

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
guobinwang: 金币+5, ★有帮助 2014-08-16 11:05:16
本帖内容被屏蔽
2楼2014-08-16 10:05:10
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guobinwang

金虫 (小有名气)
谢谢您的回复。我算的f/i是200多点儿，难道不能确定是过渡态？
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空中雄鹰，陆地猛虎，水中蛟龙
3楼2014-08-16 11:04:57
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gauss98

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
guobinwang: 金币+5, ★有帮助 2014-08-16 15:25:56
本帖内容被屏蔽
4楼2014-08-16 11:52:16
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guobinwang

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gauss98 at 2014-08-16 11:52:16
如果要找的是化学反应的过渡态，这个虚频感觉有点小
像个构象转变的过渡态

不知道你用的什么软件，可以用IRC或者反应路径之类的东西验证过渡态，虽说比较耗时，但开始确认一下没有坏处...

再次感谢您抽时间回复，我们用的VASP，我搜寻的好些过渡态的虚频大都在100到300之间，很少有超过500的。您觉得如果拿这些虚频值去偷文章的话，会不会因为续聘太小而被拒收啊？
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空中雄鹰，陆地猛虎，水中蛟龙
5楼2014-08-16 15:28:49
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gauss98

禁虫 (正式写手)
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

guobinwang
6楼2014-08-16 15:41:03
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guobinwang

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by gauss98 at 2014-08-16 15:41:03
“您觉得如果拿这些虚频值去偷文章的话，会不会因为续聘太小而被拒收啊？”
有些赞逻辑

虚频大小是体系决定的，你要做的是找到它，并用证据确认，来反应体系客观存在的性质。
我只是根据我的经验觉得化学反应 ...

好的，非常感谢您能不厌其烦的回答我的问题，再次表示感谢。您提到“你找到了并且有证据确认了”，这里的证据是找出其他文献里的虚频值为200一下的文章吗？
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空中雄鹰，陆地猛虎，水中蛟龙
7楼2014-08-16 16:06:31
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guobinwang

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by gauss98 at 2014-08-16 15:41:03
“您觉得如果拿这些虚频值去偷文章的话，会不会因为续聘太小而被拒收啊？”
有些赞逻辑

虚频大小是体系决定的，你要做的是找到它，并用证据确认，来反应体系客观存在的性质。
我只是根据我的经验觉得化学反应 ...

您的这次应助不知道怎么了不能给您金币了，送您一朵红花吧！
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空中雄鹰，陆地猛虎，水中蛟龙
8楼2014-08-16 16:08:57
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zh11111

银虫 (正式写手)

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您好我想请教一下：我研究的是一个A+B生成AB的反应，A分子掺进B结构中同时改变B原有的结构。要研究过渡态就要确定初始与最终的结构。现A,B,AB的初始结构都已优化，接下来要做的就是将A分子放到B结构中优化，使得与最终结构AB对应。那么问题是，比如初始状态的B结构是四方相7 4 15，最终结构是四方相8  8 13，那我该怎么优化初始结构使得初始与终止的晶胞参数相一致呢（换句话说，初始结构与最终结构晶胞参数不同能否研究过渡态）？
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9楼2015-10-16 08:32:19
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