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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » NCBI的Blast比对，出现 "No significant similarity found"
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
10楼: Originally posted by swach at 2014-08-15 17:28:34
主要是我以前都是选择最后一项“16S ribosomal RNA (Bacteria and Archaea)”这次还是选择这个选项，就没有比对结果，我有点蒙。为什么我现在的测序结果用这个选项就出不来结果呢？只能选择“Nucleotide collectio ...

不是16s，选择16s数据库比对，就像在西红柿地里摘辣椒一样。。。。。。
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做一个阳光、开朗的小和尚
11楼2014-08-15 20:14:22
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
swach(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-08-16 12:49:02
引用回帖:
10楼: Originally posted by swach at 2014-08-15 17:28:34
主要是我以前都是选择最后一项“16S ribosomal RNA (Bacteria and Archaea)”这次还是选择这个选项，就没有比对结果，我有点蒙。为什么我现在的测序结果用这个选项就出不来结果呢？只能选择“Nucleotide collectio ...

你比对时选择“16S ribosomal RNA (Bacteria and Archaea)”选项，意思就是只搜索该类型的序列库，你的序列不属于16s，所以肯定就搜不到相似性序列。你回复的结果是来源于细菌的呀。
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12楼2014-08-15 21:20:06
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swach

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-08-15 20:14:22
不是16s，选择16s数据库比对，就像在西红柿地里摘辣椒一样。。。。。。...

你好，我有问题想请教，能留个联系方式吗？谢谢
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13楼2014-08-20 10:12:41
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by swach at 2014-08-20 10:12:41
你好，我有问题想请教，能留个联系方式吗？谢谢...

1107461196
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做一个阳光、开朗的小和尚
14楼2014-08-20 10:42:55
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海藻森林

新虫 (初入文坛)
我比对其它序列时用blastn也得到“No significant similarity found”，但是改成用blastx就得到了结果，可以试试；但是16S片段我不懂。
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15楼2015-07-01 23:17:27
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