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allen.tsui金虫 (正式写手)
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《读懂天然产物系列》-5-”面朝大海，不只花开“-读一篇”龙“形天然产物文献
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 您的选择：《读懂天然产物系列》诚邀您撰写属于您自己的文献评论！撰写链接：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7732034&fpage=1 引言 这一切还要从1998年的夏天说起，具体到哪一天就不知道了，只知道新西兰惠灵顿蔚蓝色的海湾上泛起了一片红。 如果是在欣赏风景来着，蓝色夹杂些红色呈现在海水中看起来还是很漂亮的，但是科学告诉我们这是一种赤潮现象，也是新西兰惠灵顿海湾周围生物不幸的开始。 刚开始，生长在赤潮海域中的鱼、牡蛎等生物相继出现了死亡状况，随后生活在这片海域附近的一些人也患上了不同程度的干咳、头痛等疾病。这些状况的出现不得不引起科学家的注意，经过调查，科学家发现造成此次灾难的元凶是一种未知海藻，随后被命名为Karenia brevisulcata 。与此同时，本文要介绍的主角（附件1, Yuka Hamamoto, Kazuo Tachibana, Patrick T. Holland, et al. Brevisulcenal-F: A Polycyclic Ether Toxin Associated with Massive Fish-kills in New Zealand. J. Am. Chem. Soc. 2012.）渐渐浮出水面。 正文 A 联想 "科研工作者要具有一定的联想能力，而这种能力往往是建立在对大量的文献调研与分析上。" 在查阅Karenia（凯伦藻属）其他种时，研究者发现同属的Karenia brevis（短凯伦藻）和Karenia mikimotoi（米氏凯伦藻）能分别产生brevetoxins和gymnocins毒素，那么 Karenia brevisulcata那么Karenia brevisulcata是否也产生毒素呢？这只有通过对其进行初步的毒性试验来验证了。相关研究证实了事先的推断，详见附件3。 B 效率 "当有了目标之后，如何才能尽快达成就涉及到方法论的范畴了。" 细胞毒性追踪指导分离，本是老生常谈的话题了，但在本篇文献中被用到了极致。不断的通过毒性追踪，直至分离出目标化合物。这些是值得深思的，比如有时候方法都为人所知，只是不同的人在运用时，其产生的作用是不同的。 C 坚持 "化合物的鉴定工作是枯燥的，这中间要有对各种分析技术的灵活选择，也要有做好长期解析的心态，然后坚持至胜利。" 在对Brevisulcenal-F的解析过程中，科研工作者用上了“十八般武艺”并花费了1年多的时间，最终将Brevisulcenal-F结构鉴定为一个类似于龙形的多环醚。结构如下图： D 严谨 "是人难免就会有纰漏，科研人员也是人。如何避免纰漏的产生，这就涉及到工作中是否严谨了。" 从解出出的Brevisulcenal-F结构看，其碳、氢、氧数量巨大，各环之间连接有序，最终形成了多环醚。但是Brevisulcenal-F的结构信息表现在核磁图谱上就很复杂了，所以在解析过程中可能会出现个别纰漏，于是采用另外一种方法去验证就不免提上了日程。基于前人对类似结构的解析经验，本篇文献采用的是先制备出Brevisulcenal-F的衍生物，然后采用MS/MS方法，最终通过对各个碎片离子峰的确认，证实了先前对Brevisulcenal-F的解析是正确的。 E 亮点 1. 文章的选题很有意义。本篇文献就新西兰惠灵顿发生的赤潮后引起的危害为切入点。 2. Brevisulcenal-F出自一个新发现的物种（Karenia brevisulcata）中，且结构很新颖。Brevisulcenal-F出自一个新被发现的物种为文章增色了不少。多环醚类化合物虽然从海洋生物出分离出过，但是Brevisulcenal-F的结构还是有区别于以前发现的多环醚的，用文献中的话就是“NMR and MS/MS analyses revealed the complete structure for KBT-F, which is characterized by a ladder-frame polyether scaffold, a 2-methylbut-2-enal terminus, and an unusual substituted dihydrofuran at the other terminus”。 3. Brevisulcenal-F含量在Karenia brevisulcata中含量很多，且毒性很强。文章中说“we report the structure of brevisulcenal-F which is one of the most abundant toxins in K. brevisulcata”， “The mouse lethality of KBT-F was estimated to be 0.032 mg/kg”。另外，这个链接（http://www.u-tokyo.ac.jp/en/utokyo-research/research-news/brevisulcenal-f/）给出了Brevisulcenal-F毒性的具体参数，是氰化钾的300倍。以上不就暗示了Brevisulcenal-F是造成新西兰惠灵顿附近海域各种生物危害的罪魁祸首了吗?My god!!!这解决了多大问题啊，虽然仅仅只是暗示，是推测。话说回来，无疑给文章增分很多！ 4. Brevisulcenal-F结构的确认是经过很严谨的实验得到的。首先，经过各种常规的波谱学实验得到Brevisulcenal-F的结构，最后又经过MS/MS实验进一步确认。我想，这么严谨的实验无疑是打动JACS编辑的原因之一。 番外 1. a 通讯作者介绍：Masayuki Satake (佐竹真幸)，东京大学理科化学部副教授，主要从事海洋天然产物研究。摘自：http://www.s.utokyo.ac.jp/en/people/index.php/SATAKE. b 本篇文献的作者以及通讯作者的合影。摘从：http://d.hatena.ne.jp/TodaiGCOE/20120323. 中间为作者Yuka Hamamoto（浜本优香）；右边为通讯作者Masayuki Satake (佐竹真幸) c 东京大学对Brevisulcenal-F相关工作的介绍：http://www.u-tokyo.ac.jp/en/utokyo-research/research-news/brevisulcenal-f/. 2. 新西兰研究海洋生物的Cawthron Institute: http://www.cawthron.org.nz/analytical-services/. 3. Brevisulcenal-F类似结构的全合成。全合成大牛KCN对Maitotoxin（刺鱼毒素）的全合成工作。 Maitotoxin 4. 海洋天然产物的相关综述。NPR上几乎每年一篇对海洋天然产物的综述，现上传近三年的文章。详见附件4。 以上只是我读完文献的一些感受（仅为抛砖引玉），由于个人水平有限，还望各位海涵，谢谢！ 淘帖链接：http://muchong.com/bbs/taotie.php?action=view&ttid=55868.欢迎大家来订阅 上一帖链接：《读懂天然产物系列》-4-“变型”金刚：绝迹重生 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7676565&fpage=2 《读懂天然产物系列》开帖篇地址：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7538755&fpage=1[ Last edited by allen.tsui on 2014-8-11 at 21:46 ] |
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本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 第一篇：Brevisulcenal-F,_JACS_2012.pdf
- 附件 2 : 第二篇：Supporting_information_for_Brevisulcenal-F,_JACS_2012.pdf
- 附件 3 : 第三篇：Harmful_Algae,_2012.pdf
- 附件 4 : 第四份：Marine_natural_products,_NPR2012-2014.rar
2014-08-10 23:35:29, 510.61 K
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wangkaibo123
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allen.tsui: 回帖置顶 2014-08-11 20:47:00
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allen.tsui: 回帖置顶 2014-08-11 20:47:00
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曾几何时，自己也曾怀着一腔热血想从事海洋天然产物的研究，但是老板没给这个机会，现在就从事了植物的研究。是一种机遇，也是一种幸运，自己在3年的努力中也发了比较好的文章，可以说很对得起自己的这些年，无论别人怎么评论，自己还是感觉很知足的。谨以此纪念不能从事海洋微生物研究的遗憾。 小东写的文献评论很用心，也很仔细，从一篇文献引出了这篇文献的方方面面，甚至连作者的介绍都进行了阐述，实在是令人钦佩。这点，对我来说肯定是做不到的。向你学习学习再学习！从这里也看出这样系统的撰写文献评论，对大家都是很有帮助的，所以希望广大虫友能积极参与，详见： 您的选择：《读懂天然产物系列》诚邀您撰写属于您自己的文献评论！ 撰写链接：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7732034&fpage=1 此英文原文献我没看，但是感觉小东你已经评论得很好了，文献的选题思路，提出问题，解决问题的思路是很明确的，也很合理，虽然结构很复杂，但是作者用核磁和MS进行了解析，吻合性非常好，大家也公认，并且合成化学家对此类似物还进行了合成，的确很了不起。做天然药化的，能得到世界大牛的支持实乃是万幸啊，无论是否成药，研究体现了他的价值性，就是最好的。能与实际相结合，我觉得就是最成功的科研了。 满满的都是褒义评价，等我认真看看文献再给你提点疑问啊，哈哈。最后谢谢小东的竭力支持，你的撰写很成功，期待本系列越办越好！大家一起加油！  |
123楼2014-08-11 09:50:25
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allen.tsui(金币+1): 谢谢参与
allen.tsui(金币+1): 谢谢参与
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祝福 [ 发自小木虫客户端 ] |
2楼2014-08-10 23:42:23
hukun100 
木虫 (正式写手)
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6楼2014-08-10 23:59:51
