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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】如何构建PdWO4晶体结构
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sunmuer

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何构建PdWO4晶体结构

现在已经有了PdWO4的晶格参数，如何构建呢？
我建模的时候只能画出一个O，其他的O怎么弄上去呢？
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出清水而不染
1楼2008-04-10 10:23:35
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jghe

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
sunmuer(金币+2,VIP+0):谢谢，我试试看
查CCSD不就完了
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2楼2008-04-10 15:05:55
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hopingzmn

金虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢指导
sunmuer(金币+2,VIP+0):谢谢，我试试看，你的说明很详细，非常感谢
1. File 》Import 》点击Structures文件夹，选择一个结构类似，也就是属于同一点群的结构，导入直接修改晶格参数即可；
2. 如果没有，但是你知道PbWO4属于哪一点群，在3D图形文件界面下，点击Build 》Build crystal，在弹出的Build Crystal对话框中的Space Group标签，Enter group中输入点群名字；在Lattice Parameters标签中修改晶格参数即可。
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淡定
3楼2008-04-10 15:16:22
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):鼓励新虫踊跃发言
sunmuer(金币+2,VIP+0):非常感谢你的帮忙！
建立类似的空间群后，修改晶格参数后，将原子替换掉，先选择要替换的原子，再点击菜单栏中的modify——modify elements——选择Pd或W或O。构建即完成。之后就可以几何优化，计算别的性能啥的了。
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
4楼2008-04-10 17:03:34
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sunmuer

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hopingzmn at 2008-4-10 15:16:
1. File 》Import 》点击Structures文件夹，选择一个结构类似，也就是属于同一点群的结构，导入直接修改晶格参数即可；
2. 如果没有，但是你知道PbWO4属于哪一点群，在3D图形文件界面下，点击Build 》Build crys ...

我的原子都没有加入呢，怎么替换？
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出清水而不染
5楼2008-04-11 07:02:57
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sunmuer

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2008-4-10 17:03:
建立类似的空间群后，修改晶格参数后，将原子替换掉，先选择要替换的原子，再点击菜单栏中的modify——modify elements——选择Pd或W或O。构建即完成。之后就可以几何优化，计算别的性能啥的了。

修改晶格参数后，不是还没有填充原子么？怎么替换呢？
我在build/build crystal/中，选择了晶格参数中给定的点群，然后输入了a，b，c
这时候只是出来个大盒子而已，里面没有任何的元素。

我把晶格参数发上来，帮忙看看怎么做，谢谢！

空间群I41/a
晶格常数a5.456 b5.456
C 12.0222
beta  90°
z   8      代表什么？      
密度(g/cm3)  8.12
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出清水而不染
6楼2008-04-11 07:08:16
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sunmuer

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2008-4-10 17:03:
建立类似的空间群后，修改晶格参数后，将原子替换掉，先选择要替换的原子，再点击菜单栏中的modify——modify elements——选择Pd或W或O。构建即完成。之后就可以几何优化，计算别的性能啥的了。

修改晶格参数后，不是还没有填充原子么？怎么替换呢？
我在build/build crystal/中，选择了晶格参数中给定的点群，然后输入了a，b，c
这时候只是出来个大盒子而已，里面没有任何的元素。

我把晶格参数发上来，帮忙看看怎么做，谢谢！

空间群I41/a
晶格常数a＝b=5.4679  
C= 12.0222
beta  90°
z   8      代表什么？      
密度(g/cm3)  8.12



Atom (site) Oxid.        x, y, z,                    B,     Occupancy
W1        (4a)        6         0.        0.250        0.125        0        1
Pb1        (4b)        2         0.        0.250        0.625        0        1
O1        (16f)        -2        0.23170(65)        0.11220(58)        0.04300(36)        0        1
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出清水而不染
7楼2008-04-11 07:32:06
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
哦，忘说了，你点build，再点击add atoms,就可以添加原子了。我在版面上发了个关于CASTEP的教程，你可以看看建立晶体模型的过程，非常详细，对你会很有帮助的。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=760979&fpage=3

[ Last edited by aylayl08 on 2008-4-11 at 09:35 ]
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
8楼2008-04-11 09:26:49
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hopingzmn

金虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
sunmuer(金币+2,VIP+0):谢谢，开始的时候我弄成了笛卡儿坐标，改成分子坐标后，结构建立了。
引用回帖:
Originally posted by sunmuer at 2008-4-11 07:32:


修改晶格参数后，不是还没有填充原子么？怎么替换呢？
我在build/build crystal/中，选择了晶格参数中给定的点群，然后输入了a，b，c
这时候只是出来个大盒子而已，里面没有任何的元素。

我把晶格参数发 ...

出来的是个空盒子才是正常的，然后点击Build 》Add atoms，弹出的对话框中点Atoms标签，修改Element，点击右边的“...”会出来一个元素周期表，选择需要的原子；然后在a：b：c：后面的小框中输入你有的坐标，这个都是分数坐标，你要确认Atoms标签右边的Options标签中的Coordinate System对应的是Fractional。其他不用管了，采用默认，点击Add，添加了一种原子。接着同样的方法添加其他类原子。
试试看

另外，你说的那个z 8我也不是很清楚代表什么。
再另外，你要建的结构是PdWO4还是PbWO4？
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淡定
9楼2008-04-11 09:27:46
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢提醒
不是光修改参数，他的意思是让你导入一个对称性质相似的晶体，而不只是个框架
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聪明人知道自己是傻子，傻子以为自己是聪明人
10楼2008-04-11 09:32:24
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