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quanzx

铁虫 (初入文坛)

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专业: 环境微生物学

[交流] 复旦大学生命科学学院微生物分子生态学实验室招博士生

复旦大学生命科学学院微生物学和微生物工程系全哲学教授实验室招博士生和硕士生。
全哲学老师主要研究方向为微生物分子生态学。
现想招收以下几个方向的学生：
1）氨氧化和甲烷氧化相关微生物研究：正在对奇异（unusual）甲烷氧化菌进行深入分析。
需要做的研究：通过土壤样品的不同条件下的实验室培养，研究各类微生物之间的相互关系；并通过富集培养富集特定功能微生物。
要求：要有较高动手能力，能独立进行土壤培养，物化指标检测和分子生物学实验等。

2）元基因组和元转录组分析相关的研究：正在通过数据挖掘分析氨氧化和甲烷氧化相关微生物的全球分布。
需要做的研究：整合现有的多个软件，进行对公共数据库中元基因组或元转入组相关的数据挖掘以及自己实验室相关测序结果的深入分析。
要求：对各种软件的学习能力较强，愿意通过编程来整合多个软件，并对数据比较敏感。
或对各种代谢途径比较了解，有扎实的生化基础。

对学生的基本要求：谢绝只关心文凭的学生，要有以后一直走科研道路的目标。

联系方式: quanzx@fudan.edu.cn

全哲学老师简介：全哲学老师1997年毕业于北京大学化学与分子工程学院，2005年在韩国科学技术院（KAIST）生物科学系获得博士学位，并以讲师身份来到复旦大学生命科学学院并建立自己实验室。2013年入选教育部新世纪优秀人才支持计划。现为PLoS ONE, Journal of Microbiology, The Scientific World Journal等SCI杂志的编委。

代表论文：
1. Xiao-Ran Li, Yi Lv, Han Meng, Ji-Dong Gu, Zhe-Xue Quan* Analysis of microbial diversity by pyrosequencing the small-subunit ribosomal RNA without PCR amplification. Applied Microbiology and Biotechnology, 98, 3777-3789, 2014.
2. Zi-Ye Hu, Yue-Zhu Wang, Wan-Taek Im, Sheng-Yue Wang, Guo-Ping Zhao, Hua-Jun Zheng*, Zhe-Xue Quan* The First Complete Genome Sequence of Class Fimbriimonadia in Phylum Armatimonadetes. Plos One, 9, e100794, 2014.
3. Jemaneh Zeleke, Qiang. Sheng, Jian-Gong Wang, Ming-Yao Huang, Fei Xia, Ji-Hua Wu, Zhe-Xue Quan* Effects of Spartina alterniflora invasion on the communities of methanogens and sulfate-reducing bacteria in estuarine marsh sediments. Frontiers in Microbiology, 4, 243,2013.
4. 全哲学, 追寻被“遗漏”的微生物，微生物学通报，2013, 40(1), 34-43.
5. Dan-Ping Mao, Quan Zhou, Chong-Yu Chen, Zhe-Xue Quan* Coverage evaluation of universal bacterial primers using the metagenomic datasets. BMC Microbiology 12:66, 2012.
6. Wan-Taek Im, Zi-Ye Hu, Kyoung-Ho Kim, Sung-Keun Rhee, Han Meng, Sung-Taik Lee and Zhe-Xue Quan* Description of Fimbriimonas ginsengisoli gen. nov., sp. nov. within the Fimbriimonadia class nov., of the phylum Armatimonadetes. Antonie van Leeuwenhoek Journal. 102,307-317, 2012.
7. Bi-Wei Feng, Xiao-Ran Li, Jin-Hui Wang, Zi-Ye Hu, Han Meng, Ling-Yun Xiang, Zhe-Xue Quan*. Bacterial diversity of water and sediment in the Changjiang estuary and coastal area of the East China Sea. FEMS Microbiology and Ecology. 70, 236-248, 2009.
8. Xiao-Ran Li, Bing Du, Hai-Xia Fu, Ruo-Fan Wang, Jin-Huan Shi, Yue Wang, Mike S.M. Jetten, Zhe-Xue Quan*. The bacterial diversity in an anaerobic ammonium-oxidizing (anammox) reactor community. Systematic and Applied Microbiology. 32，278-289, 2009.
9. Zhe-Xue Quan, Sung-Keun Rhee, Jian-E Zuo, Yang Yang, Jin-Woo Bae, Ja Ryeong Park, Sung-Taik Lee, Yong-Ha Park. Diversity of ammonium-oxidizing bacteria in a granular sludge anaerobic ammonium-oxidizing (anammox) reactor. Environmental Microbiology. 10, 3130-3139, 2008.

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