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房然

铁虫 (小有名气)


[求助] 怎么在RCSB PDB数据库中,將2012年以来更新的蛋白质一次性全部下载下来? 已有2人参与

各位前辈:
       自己实验室在做数据库,然后需要2012年以来所有更新的PDB数据库中的蛋白质,请问怎么下载?然后有没有详细的PDB数据库应用指南,最好是英文的,中文额你的也可以。
多谢!
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sk101

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

PDB数据库主页有advanced search,筛选条件选择release date为2012,会导出一个pdb ID列表,最后写个脚本在https://files.rcsb.org/download/上根据列表把所有pdb下载到本地
3楼2020-02-12 19:24:49
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395443832

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
那个网站上有 可以自动下载所有的蛋白质的PDB结构,不知道能不能在加上根据时间?但是可以写脚本,筛选出来
(>^ω^<)喵
2楼2014-08-02 14:05:40
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