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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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tsihu

捐助贵宾 (小有名气)

[交流] [求助] 关于分子能量的计算与处理

本人研究的分子有两种可能构象,现在想计算分别的分子能量进行比较以确定哪一种更为稳定.感到困扰的是这个分子能量是指构型优化后的out文件里的SCF Done后的能量还是单点能计算后得到的能量.
还有就是怎么用零点能(zero point energy)进行修正.

望知晓这方面的先行者不吝指教.谢谢.
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我思故我为
1楼 2008-04-07 16:36:39
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tsihu

捐助贵宾 (小有名气)
首先谢谢三位的回复.
那就是说光是构型优化计算里也能给出相对可靠的分子能量值,而如果想得到更为准确的数值的话就要在构型优化的基础上进行SP运算,同样在SCF Done后面得到所要的能量值.如果要进行零点能修正的话,在构型优化的基础上用同样的方法和基组再进行频率分析计算,得到修正零点能后的分子总能量.
是这样子吗.

对了,各个能量的单位都是Hartree吧.
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我思故我为
5楼2008-04-08 10:29:33
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查看全部 8 个回答

liliracial

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
既然有两种可能构型，一般都是以这两种构型为初始构型，分别进行构型优化，优化后，看最终的构型相同还是不相同，如果不相同，那么再比较优化后OUT文件中的能量。
如果要进行零点能修正，则在构型优化后进行频率计算freq，那么OUT文件中就直接有零点能以及修正后能量的结果。
建议在计算时，仔细看看Gaussian03手册中关于OPT以及Freq频率计算的相关内容。里面涉及你需要的东西。
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修炼成一块愚钝的大石头
2楼2008-04-07 16:46:06
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SHY31

至尊木虫 (知名作家)

小木虫研究生院西南地区区长

优秀版主
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
楼上正解

比较分子稳定性、

加个频率计算

然后用HOMO-LUMO的能量差来比较吧
赞一下(10人) 回复此楼
小木虫研究生院
3楼2008-04-07 17:50:18
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jghe

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):又见高手 呵呵
优化和单点计算都能给出能量。优化对基组和方法的依赖性不是很大，一般用较小基组就可以了，但是能量则不同，往往需要加大基组，比如增加极化函数，弥散函数。所以LZ的情况，可以直接比较优化后的能量（如果可以分清楚的话）也可以在优化的基础上进行更大基组的单点计算已获得更为准确的能量值
零点能矫正同楼上
频率计算是为了检测找到的结构是否为局域极小点，结构是否稳定
HOMO-LUMO gap 一般只表示分子的化学稳定性，热力学稳定性可以计算其键能
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4楼2008-04-07 20:08:30
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