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关于454测序后序列拼接问题
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| 公司测序完成后拼接了3个序列重叠群,但是序列中的是否存在重复序列我并不好判断,引物扩增,发现确定其中一个为重复序列,但是另外两个重叠群是否存在重复序列我并不好判断,让公司把原始测序序列发过来但是扩展名为.sff,我的序列拼接软件并不能打开454所产生的.sff格式序列,各位在基因组组装中判断重复序列及打开.sff格式文件方面有什么方法及建议呢?在此多谢。 |
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