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zxx103837

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps dump dihedral/local 输出二面角

我打算用LAMMPS输出分子链的二面角,命令定义如下:
compute 1 all property/local datom1 datom2 datom3 datom4 dtype
compute 2 all dihedral/local phi   
dump 8 all local 1000 dump.dihedral.*.lammpstrj index c_1[1] c_1[2] c_1[3] c_1[4] c_1[5] c_2[1] c_2[2]
我要输出二面角,index后的向量按上面定义,出错:dump local computer does not calculate local array
按照我对 bond、angle的定义,这个二面角的定义不应该有问题,我定义的bond 和 angle 都能正常输出,就dihedral不行   求大神指导一下  哪出错了
问题应该就出现在 index c_1[1] c_1[2] c_1[3] c_1[4] c_1[5] c_2[1] c_2[2] 上
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Pipimerry

新虫 (初入文坛)

你好,这个bond 怎么解决,能私聊吗
3楼2019-11-10 10:13:31
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查看全部 8 个回答

zs806750658

铜虫 (正式写手)


同学你好,请问你这个输出二面角的问题解决了吗,我也遇到同样的问题,不知道如何解决,请问能否指点一下,不胜感激。
2楼2016-01-01 01:20:20
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4楼2020-01-02 11:19:58
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5楼2020-01-03 14:29:15
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