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njcaochen

新虫 (初入文坛)

[交流] 怎样利用AllenBrainAtlas证明六个基因在大脑内共表达 已有3人参与

RT老板要我利用ABA数据库研究TUT1(ID: 64852) ;   Larp7(ID: 51574 ) ;Lin28A (ID: 79727 );  CCNK (ID: 8812); CDK12(ID: 51755 );CDK13 (ID: 8621)在人或小鼠脑内的表达情况。
我写信给ABI研究院寻求解决方法:怎样使用从他们网站上下载的ISH和微阵列数据。一个叫吉尔伯特的研究员回答了我,她要我先读data normalization white paper,读懂那个会给我一个better view,我根本读不懂
我搜到一篇冷泉港的综述Computational neuroanatomy and co-expression of genes in the adult mouse brain, analysis tools for the Allen Brain Atlas他们利用ABA的数据建立了一个尼古丁成瘾性基因数据库
我还搜到一篇以色列人跟冷泉港合作的文章Co-expression Profiling of Autism Genes in the Mouse Brain利用冷泉港这个体系从一个自闭症数据库中筛选出26个脑内高表达的基因并分成两个共表达的类群我想效仿以色列人这篇文章研究上述六个我关心的基因在人脑或小鼠脑内的表达情况该怎么做,首先下面这种图我就看不懂怎样利用AllenBrainAtlas证明六个基因在大脑内共表达
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生物信息学

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njcaochen

新虫 (初入文坛)

2楼2014-07-24 02:11:58
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njcaochen

新虫 (初入文坛)

3楼2014-07-24 11:19:26
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caitlin0626

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不懂,感觉很高端了,超出本人范围了

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-07-26 11:25:15
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njcaochen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by caitlin0626 at 2014-07-26 11:25:15
不懂,感觉很高端了,超出本人范围了

谢谢你,您水平肯定比我高,我只是个土硕,您对我这个难题有任何建议请帮帮我
5楼2014-07-28 16:04:17
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richard58272

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我不是专门做基因方面工作的,不过感觉这个题目需要生物信息学方面的背景,最好完成文献调研后,整理一下工作进展和未解决的问题,求助于你的导师,有问题找导师才是正解。祝你顺利。P.S.,我也打算开始ASD方面的研究工作,刚刚开头,处于文献调研阶段。
6楼2014-10-10 09:11:39
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青苔1127

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你后面弄明白了么?
7楼2018-12-21 21:03:17
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