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汕头大学海洋科学接受调剂
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飞利白

新虫 (初入文坛)
你好想请教下AC建模如何画出聚合物的啊，初学不太会。我要用MS中Amorphous Cell建模polyamide melt聚合物，我现在要建的是MPD和TMC生成的polyamide melt聚合物。construction中Z方向周期性条件去掉。能否知道下，多谢。具体点
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11楼2014-07-24 14:04:08
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760912642

银虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by hanhan1020 at 2014-07-22 09:15:58
display-incell...

您好！谢谢您之前的回复。我现在遇到了一些问题，本来认为 水分子直接画好添加到无定型结构中就可以了，但是我查阅了一些文献，说是水分子模型采用的是F3C力场，参考文献上有相关的 参数，但是我不知道用到自己的 建模中时如何使用F3C力场进行水分子模型的建立。另外，氢氧根的模型建立也是问题，请给予指导。谢谢！
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12楼2014-08-19 16:50:51
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hanhan1020

木虫 (正式写手)
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12楼: Originally posted by 760912642 at 2014-08-19 16:50:51
您好！谢谢您之前的回复。我现在遇到了一些问题，本来认为 水分子直接画好添加到无定型结构中就可以了，但是我查阅了一些文献，说是水分子模型采用的是F3C力场，参考文献上有相关的 参数，但是我不知道用到自己的  ...

直接用 COMPASS力场不可以？
羟基建模  画好之后需要分配一下电荷的
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没有读不下的书，只有不努力的自己。
13楼2014-08-20 08:56:53
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760912642

银虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by hanhan1020 at 2014-08-20 08:56:53
直接用 COMPASS力场不可以？
羟基建模  画好之后需要分配一下电荷的...

好像不行吧，我看好多文献都是用的F3C力场进行的水分子建模，而F3C力场是自己创建的，根据原始的文献进行的拟合参数创建的 新的立场。氢氧根这个要求没有很严格。
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14楼2014-08-20 10:12:09
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760912642

银虫 (小有名气)
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14楼: Originally posted by 760912642 at 2014-08-20 10:12:09
好像不行吧，我看好多文献都是用的F3C力场进行的水分子建模，而F3C力场是自己创建的，根据原始的文献进行的拟合参数创建的 新的立场。氢氧根这个要求没有很严格。...

还有就是自初始简历无定型结构的 时候需要进行坐标的设定吗？
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15楼2014-08-20 10:14:02
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hanhan1020

木虫 (正式写手)
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14楼: Originally posted by 760912642 at 2014-08-20 10:12:09
好像不行吧，我看好多文献都是用的F3C力场进行的水分子建模，而F3C力场是自己创建的，根据原始的文献进行的拟合参数创建的 新的立场。氢氧根这个要求没有很严格。...

你用的什么软件？MS里对水分子可以用ＣＯＭＰＡＳＳ描述啊
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没有读不下的书，只有不努力的自己。
16楼2014-08-20 15:59:25
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760912642

银虫 (小有名气)
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16楼: Originally posted by hanhan1020 at 2014-08-20 15:59:25
你用的什么软件？MS里对水分子可以用ＣＯＭＰＡＳＳ描述啊...

就是用的MS，对，是有对水分子模型的描述。但是我们领域里相关的文献都写的是F3C力场建立水分子模型。而且我刚开始学习模拟，不知道在使用Forcite模块进行结构优化还有动力学时是否还要进行除了该模块以外的参数的设置。
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17楼2014-08-20 16:45:20
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hanhan1020

木虫 (正式写手)
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17楼: Originally posted by 760912642 at 2014-08-20 16:45:20
就是用的MS，对，是有对水分子模型的描述。但是我们领域里相关的文献都写的是F3C力场建立水分子模型。而且我刚开始学习模拟，不知道在使用Forcite模块进行结构优化还有动力学时是否还要进行除了该模块以外的参数的 ...

额　我也是做ＭＳ的ｆｏｒｃｉｔｅ模块的　　可是我用的就是ＣＯＭＰＡＳＳ　力场
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18楼2014-08-20 20:29:25
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760912642

银虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by hanhan1020 at 2014-08-20 20:29:25
额　我也是做ＭＳ的ｆｏｒｃｉｔｅ模块的　　可是我用的就是ＣＯＭＰＡＳＳ　力场...

哦！那么请问需要建立坐标吗？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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19楼2014-08-21 07:39:50
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hanhan1020

木虫 (正式写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by 760912642 at 2014-08-21 07:39:50
哦！那么请问需要建立坐标吗？
...

不需要
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20楼2014-08-21 08:50:25
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