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敏sunflower

金虫 (小有名气)

[求助] 动力学能量

请求大侠们的指点!!!!
最近在做聚合物的分子模拟,Cell中包含两条聚合物链段,每个链段含2900个原子,Cell中的总原子数接近6000个.构建的Cell进行能量最小化之后,进行500ps NPT动力学。但是输出的能量图中发现总能量total energy大于0,这样的结果是否可以呐?total energy大于0能否说明建立的Cell属于合理的结构?(附件中是截图,动力学还没有完成,但是能量已经趋于平衡了)

动力学能量
1.PNG
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