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敏小敏2013

铁虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 2350342
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专业: 植物病理学

[求助] 霉菌的鉴定出现了分子鉴定结果和biolog鉴定结果冲突信哪个已有2人参与

求助各位大虾,。。没有金币啊。求可怜

。最近在做一株霉菌的鉴定。。姑且叫它C菌。
做了ITS的扩增，在NCBI上比对以后做了进化树。结果C菌和A菌和B菌在一个分支上。
然后做了BIOLOG鉴定。。。结果是D菌！！我要怎么办，它到底是什么。。

                                                                                       68 |----------C(待鉴定)
                                       |---------------------------------------------|---------A菌（NCBIiden值100%）
---------------------------------|                                                       |---------C菌（NCBIiden值100%）
|                                     |-----------------------------------D菌（biolog结果，NCBI上inden值99%）
|
|----------------------------------------------------------------X菌

求帮忙。。。我快崩溃了。。。

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1楼2014-07-15 19:36:50

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敏小敏2013

铁虫 (初入文坛)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by julycie at 2014-07-15 22:50:42
不好说，biolog做重复没？常规菌的看看形态吧，用18S再甄别一下，看看。

感谢你的回答。。。现在的情况是，18S的测序结果非常之好。。图谱出来所有的峰都是单峰很清楚。。所以18S的鉴别个人认为木有必要了。。。然后biolog的重复的话。。板子太贵了。。老师不可能让做重复试验了。。就是这样一种情况，不过匹配的D菌的SIM值不是很高。第二行是A菌 SIM值是0。那么我可不可以认为BIOLOG数据库里没有B菌。既然排除了C菌和A菌，那么可不可以认为就是B菌呢？