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自由黑黑

新虫 (初入文坛)

[求助] 求教关于剪切场方面的in文件

我查过手册和相关资料,说用fix deform来达到剪切场的目的,但是手册上写着是改变盒子形状(我把in文件贴出来),说白了就是压缩和拉伸的作用,我也运算了一些结果,除了单纯达到拉伸和压缩外并不能达到结构的变化。我想请教谁有研究过剪切场的相关内容,可否说一下该怎么办吗 ?还有剪切场与速度梯度有关,但是velocity指令只是改变粒子初始速度啊 ,其中有个ramp是产生速度梯度的,但是运行的时候提示要设置lattice命令,可是我的in文件与lattice无关的。

dimension                      3
boundary                      p p p
units                       lj
atom_style                  molecular

neighbor                    0.3 bin
neigh_modify                every 1 delay 0

read_restart                run.1.restart

bond_style                  harmonic
bond_coeff                  1  10.0 0.86

pair_style                  dpd 1.0 1.0 34387
pair_coeff                  1  1  15.0  4.5  1.0  
pair_coeff                  2  2  15.0  4.5  1.0
pair_coeff                  1  2  50.0  4.5  1.0

#velocity                    all  create 1.0  4928459  dist  gaussian
communicate single vel yes
timestep                    0.00001
thermo                      100000

fix                         1 all nve
fix                         2 all deform 1000 x erate 0.0005 remap v

dump                        1 all custom 100000 dump.a5b5.lammpstrj id type x y z  
run                         1000000
write_restart run1.restart
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