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pdl9527

专家顾问 (小有名气)

[求助] 如何通过Mulliken_Analysis和Hirshfeld_Analysis来判断原子的杂化类型

以下是我计算己烷得到的结构,如何通过以上的分析手段得到碳的杂化类型呢?
我不知道这种方法行不行,只是看到文献中用到了,如果不行在dmol3中有其他的方法么?
ps:我不是做第一性的,只是需要用一下,能不能说点直白的,万分感谢!

还有一些population的分析结果太多就没弄上来了。

Charge partitioning by Hirshfeld method: (  0.0000    0.0000)
  C     1 charge   spin                   -0.1096    0.0000
  C     2 charge   spin                   -0.0617    0.0000
  C     3 charge   spin                   -0.0634    0.0000
  C     4 charge   spin                   -0.0634    0.0000
  C     5 charge   spin                   -0.0617    0.0000
  C     6 charge   spin                   -0.1096    0.0000
  H     7 charge   spin                    0.0343    0.0000
  H     8 charge   spin                    0.0343    0.0000
  H     9 charge   spin                    0.0367    0.0000
  H    10 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    11 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    12 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    13 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    14 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    15 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    16 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    17 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    18 charge   spin                    0.0343    0.0000
  H    19 charge   spin                    0.0367    0.0000
  H    20 charge   spin                    0.0343    0.0000

Mulliken atomic charges:
          charge    spin
C (  1)  -0.965   0.000
C (  2)  -0.582   0.000
C (  3)  -0.570   0.000
C (  4)  -0.570   0.000
C (  5)  -0.582   0.000
C (  6)  -0.966   0.000
H (  7)   0.302   0.000
H (  8)   0.302   0.000
H (  9)   0.321   0.000
H ( 10)   0.308   0.000
H ( 11)   0.308   0.000
H ( 12)   0.288   0.000
H ( 13)   0.288   0.000
H ( 14)   0.288   0.000
H ( 15)   0.288   0.000
H ( 16)   0.308   0.000
H ( 17)   0.308   0.000
H ( 18)   0.302   0.000
H ( 19)   0.321   0.000
H ( 20)   0.302   0.000
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

你指的杂化指的是杂化轨道还是?我默认前者吧。
布居分析(如Mulliken和Hirshfeld)的概念其实就是键电子归属方式,得不到杂化的方式。想要得到杂化的形式需要了解键电子的成分,Dmol3得到的轨道系数我不确定是否经过正交化。Dmol3的投影态密度有缺点,没办法进行磁量子数分波。或者间接的方式就是通过键级进行分析,可在性质中选择bond order,原则上来说,单键的键级接近1,但是也有偏离的时候。

如果想更好一些,有下列建议:
这方面的工作Gaussian、ADF或是Molpro等程序可能有更好更专业的方式,如AIM及其他,Dmol3确实在这方面有些不足。关于电子结构分析可以请教量子化学版的Sobereva,他们写了Mulitiwfn对电子结构分析非常有益,或是找找他的帖子,他肯定有更高明的办法。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-07-14 02:25:59
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