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pdl9527专家顾问 (小有名气)
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如何通过Mulliken_Analysis和Hirshfeld_Analysis来判断原子的杂化类型
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以下是我计算己烷得到的结构，如何通过以上的分析手段得到碳的杂化类型呢？ 我不知道这种方法行不行，只是看到文献中用到了，如果不行在dmol3中有其他的方法么？ ps:我不是做第一性的，只是需要用一下，能不能说点直白的，万分感谢！ 还有一些population的分析结果太多就没弄上来了。 Charge partitioning by Hirshfeld method: ( 0.0000 0.0000) C 1 charge spin -0.1096 0.0000 C 2 charge spin -0.0617 0.0000 C 3 charge spin -0.0634 0.0000 C 4 charge spin -0.0634 0.0000 C 5 charge spin -0.0617 0.0000 C 6 charge spin -0.1096 0.0000 H 7 charge spin 0.0343 0.0000 H 8 charge spin 0.0343 0.0000 H 9 charge spin 0.0367 0.0000 H 10 charge spin 0.0329 0.0000 H 11 charge spin 0.0329 0.0000 H 12 charge spin 0.0319 0.0000 H 13 charge spin 0.0319 0.0000 H 14 charge spin 0.0319 0.0000 H 15 charge spin 0.0319 0.0000 H 16 charge spin 0.0329 0.0000 H 17 charge spin 0.0329 0.0000 H 18 charge spin 0.0343 0.0000 H 19 charge spin 0.0367 0.0000 H 20 charge spin 0.0343 0.0000 Mulliken atomic charges: charge spin C ( 1) -0.965 0.000 C ( 2) -0.582 0.000 C ( 3) -0.570 0.000 C ( 4) -0.570 0.000 C ( 5) -0.582 0.000 C ( 6) -0.966 0.000 H ( 7) 0.302 0.000 H ( 8) 0.302 0.000 H ( 9) 0.321 0.000 H ( 10) 0.308 0.000 H ( 11) 0.308 0.000 H ( 12) 0.288 0.000 H ( 13) 0.288 0.000 H ( 14) 0.288 0.000 H ( 15) 0.288 0.000 H ( 16) 0.308 0.000 H ( 17) 0.308 0.000 H ( 18) 0.302 0.000 H ( 19) 0.321 0.000 H ( 20) 0.302 0.000 |
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你指的杂化指的是杂化轨道还是？我默认前者吧。 布居分析（如Mulliken和Hirshfeld）的概念其实就是键电子归属方式，得不到杂化的方式。想要得到杂化的形式需要了解键电子的成分，Dmol3得到的轨道系数我不确定是否经过正交化。Dmol3的投影态密度有缺点，没办法进行磁量子数分波。或者间接的方式就是通过键级进行分析，可在性质中选择bond order，原则上来说，单键的键级接近1，但是也有偏离的时候。 如果想更好一些，有下列建议： 这方面的工作Gaussian、ADF或是Molpro等程序可能有更好更专业的方式，如AIM及其他，Dmol3确实在这方面有些不足。关于电子结构分析可以请教量子化学版的Sobereva，他们写了Mulitiwfn对电子结构分析非常有益，或是找找他的帖子，他肯定有更高明的办法。 |
2楼2014-07-14 02:25:59