24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2349  |  回复: 1

pdl9527

专家顾问 (小有名气)

[求助] 如何通过Mulliken_Analysis和Hirshfeld_Analysis来判断原子的杂化类型

以下是我计算己烷得到的结构,如何通过以上的分析手段得到碳的杂化类型呢?
我不知道这种方法行不行,只是看到文献中用到了,如果不行在dmol3中有其他的方法么?
ps:我不是做第一性的,只是需要用一下,能不能说点直白的,万分感谢!

还有一些population的分析结果太多就没弄上来了。

Charge partitioning by Hirshfeld method: (  0.0000    0.0000)
  C     1 charge   spin                   -0.1096    0.0000
  C     2 charge   spin                   -0.0617    0.0000
  C     3 charge   spin                   -0.0634    0.0000
  C     4 charge   spin                   -0.0634    0.0000
  C     5 charge   spin                   -0.0617    0.0000
  C     6 charge   spin                   -0.1096    0.0000
  H     7 charge   spin                    0.0343    0.0000
  H     8 charge   spin                    0.0343    0.0000
  H     9 charge   spin                    0.0367    0.0000
  H    10 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    11 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    12 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    13 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    14 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    15 charge   spin                    0.0319    0.0000
  H    16 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    17 charge   spin                    0.0329    0.0000
  H    18 charge   spin                    0.0343    0.0000
  H    19 charge   spin                    0.0367    0.0000
  H    20 charge   spin                    0.0343    0.0000

Mulliken atomic charges:
          charge    spin
C (  1)  -0.965   0.000
C (  2)  -0.582   0.000
C (  3)  -0.570   0.000
C (  4)  -0.570   0.000
C (  5)  -0.582   0.000
C (  6)  -0.966   0.000
H (  7)   0.302   0.000
H (  8)   0.302   0.000
H (  9)   0.321   0.000
H ( 10)   0.308   0.000
H ( 11)   0.308   0.000
H ( 12)   0.288   0.000
H ( 13)   0.288   0.000
H ( 14)   0.288   0.000
H ( 15)   0.288   0.000
H ( 16)   0.308   0.000
H ( 17)   0.308   0.000
H ( 18)   0.302   0.000
H ( 19)   0.321   0.000
H ( 20)   0.302   0.000
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

你指的杂化指的是杂化轨道还是?我默认前者吧。
布居分析(如Mulliken和Hirshfeld)的概念其实就是键电子归属方式,得不到杂化的方式。想要得到杂化的形式需要了解键电子的成分,Dmol3得到的轨道系数我不确定是否经过正交化。Dmol3的投影态密度有缺点,没办法进行磁量子数分波。或者间接的方式就是通过键级进行分析,可在性质中选择bond order,原则上来说,单键的键级接近1,但是也有偏离的时候。

如果想更好一些,有下列建议:
这方面的工作Gaussian、ADF或是Molpro等程序可能有更好更专业的方式,如AIM及其他,Dmol3确实在这方面有些不足。关于电子结构分析可以请教量子化学版的Sobereva,他们写了Mulitiwfn对电子结构分析非常有益,或是找找他的帖子,他肯定有更高明的办法。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-07-14 02:25:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pdl9527 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 如何实现卤原子转化 +3 BT20230424 2026-05-15 7/350 2026-05-19 19:23 by bencaidai
[文学芳草园] 献血感触 +6 呀呀好傻 2026-05-19 6/300 2026-05-19 17:23 by kopsia
[基金申请] 2026山东省优青 +3 luckinging 2026-05-14 4/200 2026-05-19 16:15 by 52wls
[基金申请] 评审有感 +10 popular289 2026-05-18 16/800 2026-05-19 14:46 by popular289
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 3/150 2026-05-19 13:56 by xtlilibin
[考博] 找博士生导师 +6 小代想上岸 2026-05-15 7/350 2026-05-19 10:22 by free_fisher
[考博] 26/27申博自荐-锂/钠电池方向 5+3 狗头军师. 2026-05-15 4/200 2026-05-19 09:10 by moonboat
[基金申请] 同样的基金本子,换个专家直接从C变A! +3 国自然国社科中 2026-05-19 3/150 2026-05-19 08:50 by Equinoxhua
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +8 1234567wang 2026-05-17 10/500 2026-05-18 18:52 by zzahkj
[基金申请] 国自然上会要求 +5 无名者登山 2026-05-18 9/450 2026-05-18 17:50 by BlakeReary
[硕博家园] 考博自荐 +5 科研狗111 2026-05-13 6/300 2026-05-18 11:22 by 糊糊涂涂好
[基金申请] 青C资助名额大幅增加! +12 西葫芦炒鸡蛋 2026-05-13 16/800 2026-05-18 10:02 by Equinoxhua
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
[文学芳草园] 半夜喝咖啡 +3 myrtle 2026-05-15 5/250 2026-05-18 01:03 by 小沈2018
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人(2026.09) +3 sandyworld 2026-05-15 4/200 2026-05-17 14:38 by sandyworld
[有机交流] 求助2,4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯(CAS:2793408-99-6)的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
[文学芳草园] 风把牡丹吹跑了 +5 myrtle 2026-05-12 9/450 2026-05-15 15:27 by myrtle
[考博] 26应届毕业生考博求助 +3 wo一定上岸 2026-05-13 3/150 2026-05-14 21:47 by 明海天涯
信息提示
请填处理意见