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[交流] [求助]关于unigene

"采用100bp，90％的原则对这500条序列归并unigene，得到unigene数为315条",unigene是什么?我该如何理解这句话呢?

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1楼 2008-03-31 17:23:53

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moonfaceout

铜虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 446400
注册: 2007-10-29
专业: 分子细胞遗传学

★ ★
asr(金币+2,VIP+0)::P 多谢.o(∩_∩)o...

UniGene是从属于GeneBank的一部分，专门收集非冗余性的基因来源的clusters数据。每一个UniGene Cluster包含代表单一基因的序列和相关的信息，例如基因表达的组织类型和图谱定位信息。

也就是说unigene是好多序列的聚类结果，其中对序列中的载体、寡核苷酸、重复片段以及线粒体、核糖体等污染序列进行过滤。去除污染序列之后的序列至少要含有100bp的带有信息的序列才可作为候选序列。

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2楼2008-03-31 19:15:06

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