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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 基因组提取
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1085549163

金虫 (初入文坛)

[求助] 基因组提取 已有1人参与

求大神指点，我用天根试剂盒提取细菌基因组，提完之后跑琼脂糖凝胶电泳，为什么一条带都没有，但是我直接做16S通用引物的PCR，结果就能p出来，另外，我的菌我不知道是革兰氏阴性还是阳性，我的菌是黑色的，不加溶菌酶，加入蛋白酶K和SDS之后它就直接变得澄清了，是不是它的细胞壁就被破裂开了，是革兰氏阴性菌？
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妮妮
1楼 2014-07-05 18:01:41
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1085549163

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 俗妮儿~ at 2014-07-05 21:53:03
试剂盒提的基因组，跑胶一般是看不出来的……不用纠结了，能P出来想要的带不就可以了么……
再革兰氏试剂盒也有很多，染个色也就10min，你染个色不就知道是不是阳性菌了。还没听说过可以在提取基因组的时候 ...

用手提法是不是可以跑出来？嘿嘿我以为不加溶菌酶就能破壁，溶液变得澄清，然后就是革兰氏阴性了
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妮妮
3楼2014-07-06 09:10:39
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俗妮儿~

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dllchina: 金币+2, 鼓励应助 2014-07-06 00:06:52
试剂盒提的基因组，跑胶一般是看不出来的……不用纠结了，能P出来想要的带不就可以了么……
再革兰氏试剂盒也有很多，染个色也就10min，你染个色不就知道是不是阳性菌了。还没听说过可以在提取基因组的时候就能判断阳性还是阴性菌的方法
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2楼2014-07-05 21:53:03
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俗妮儿~

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 1085549163 at 2014-07-06 09:10:39
用手提法是不是可以跑出来？嘿嘿我以为不加溶菌酶就能破壁，溶液变得澄清，然后就是革兰氏阴性了...

是的，手提的话就能看到的。不过一般我们需要基因组测序的话才这么做，单独PCR扩增某个基因的话，试剂盒提取一下就可以了。
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4楼2014-07-06 12:25:24
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1085549163

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 俗妮儿~ at 2014-07-06 12:25:24
是的，手提的话就能看到的。不过一般我们需要基因组测序的话才这么做，单独PCR扩增某个基因的话，试剂盒提取一下就可以了。...

嘿嘿我也是做个PCR扩增，16S扩增，然后测序，因为我是做化学的不太懂，谢谢指点
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妮妮
5楼2014-07-06 13:02:01
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