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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] Gaussian确实跟不上时代发展了,并行不好 已有15人参与

测试机器:
两片E5-2680v2处理器,64G内存,普通SAS硬盘,整个机器是按照DDRIII-1600配起来的,关掉超线程后,共20个计算核心
系统为Centos 6.4

测试题:
一个已经用cam-b3lyp优化好的200多个原子的体系,有氢氧硫碳氮碘锌。基组为6-31G(d)和LanL2DZ混用。现在拿着这个构型在同等水平下,进行单点能计算,很幸运的,两次测试的cycle都是13次。

当使用12核心并行的时候,总CPU时间为33分36秒,平均每核心运行时间2分48秒
当使用20核心并行的时候,总CPU时间为43分32秒,平均每核心运行时间2分11秒

多用的八个核心似乎没有发挥出应有的效能来

现在看来,E5-2643v2,6核心3.5G主频,出厂价1500+美元
对比E5-2690v2,10核心3.0G主频,出厂价2000+美元
如果以高斯为主要工具的话,很明显应该选E5-2643v2而不是E5-2690v2

从这个意义上讲,对于高斯计算来说,E5-2697v2属于昂贵的鸡肋

应该说年前买的一堆E5-2680v2和E5-2650v2的节点都买废了,花钱买教训,可惜了几十万银子。现在看来只能一个节点交两个任务才会比较合理了。

看来以后买cpu,钱少就买E5-2637v2钱多就卖E5-2643v2就好了
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  • 附件 1 : 测试.xlsx
  • 2014-07-04 17:56:28, 14.79 K

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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个好像和CPU构架有关,好像AMD的CPU并行效率就好一些,虽然单个核心的效率很差。
我做过个测试,从8核到16核有超过70%的速度提升
从16核到32核,速度还有超过50%的提升。
我们现在买来做Gaussian的DFT计算的机器都用AMD的,性价比蛮高。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
19楼2014-07-21 20:18:07
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查看全部 20 个回答

寒雨人生

铁杆木虫 (知名作家)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
冬哥是来嘚瑟新机器的,鉴定完毕,哈哈

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-07-04 14:49:43
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南飞探

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

3楼2014-07-04 14:55:14
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newsong1900

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 寒雨人生 at 2014-07-04 14:49:43
冬哥是来嘚瑟新机器的,鉴定完毕,哈哈

同意
4楼2014-07-04 14:59:45
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